RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598038.5

GTPBP3-216, Transcript of GTP binding protein 3, mitochondrial, human

TSL 5

Gene GTPBP3, Length 2,917 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP3-216	ENST00000598038	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP3-216	ENST00000598038	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	OR5B21	A6NL26	309 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	EDDM3A	Q14507	147 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	OR5B12	Q96R08	314 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	CSTL1	Q9H114	145 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	LRP5L	A4QPB2	252 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	TMEM187	Q14656	261 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	ZNF726P1	Q15940	193 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	LTC4S	Q16873	150 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	TXN2	Q99757	166 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	APC	P25054	2843 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038		K7EP13	123 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	PSPN	O60542	156 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	BCL2	P10415	239 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	12.82	□□□□□ -0.36	3e-9	■■■□□ 17.9
GTPBP3-216	ENST00000598038	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	RNF2	Q99496	336 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	OR2H2	O95918	312 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	SELENOV	P59797	346 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	UBE2V1	Q13404	147 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038		Q6ZN92	141 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038		A0A1W2PN81	502 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	FGF12	P61328	243 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	IL24	Q13007	206 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	BSX	Q3C1V8	233 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	MUC15	Q8N387	334 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	GCM1	Q9NP62	436 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038		A0A1B0GW64	132 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	ZNF728	P0DKX0	622 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	AES	Q08117	197 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	NGB	Q9NPG2	151 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	DEGS1	O15121	323 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	CDS2	O95674	445 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	ZNF266	Q14584	549 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	PRR31	Q5SQ13	230 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	NAA60	Q9H7X0	242 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	SPINK4	O60575	86 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	GYPA	P02724	150 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	COL8A2	P25067	703 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	IL13RA2	Q14627	380 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	PTX4	Q96A99	478 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	TM2D1	Q9BX74	207 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	ADAM20	O43506	726 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	PDCD6	O75340	191 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	IL3RA	P26951	378 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	TAS2R46	P59540	309 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	ASCL4	Q6XD76	172 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	DECR2	Q9NUI1	292 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	ADM	P35318	185 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	CD177	Q8N6Q3	437 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	C17orf100	A8MU93	164 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038		F6UZH7	168 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GTPBP3-216	ENST00000598038	CHST1	O43916	411 aa		12.78	□□□□□ -0.36

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