RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 ADIRFQ15847 76 aa7.58□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 C17orf58Q2M2W7 97 aa7.58□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 BSXQ3C1V8 233 aa7.58□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF788Q6ZQV5 615 aa7.58□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 SSX9Q7RTT3 188 aa7.58□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 LYG1Q8N1E2 194 aa7.58□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC24A4Q8NFF2 622 aa7.58□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 CHODLQ9H9P2 273 aa7.58□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 PLEKHA3Q9HB20 300 aa7.58□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 TCF19Q9Y242 345 aa7.58□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa7.58□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00312Q9Y6C7 94 aa7.58□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.57□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 C11orf94C9JXX5 98 aa7.57□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 H7BYZ3 331 aa7.57□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP1R2P9O14990 202 aa7.57□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 CXorf1O96002 111 aa7.57□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 IGKV1D-33P01593 117 aa7.57□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 IGKV1-33P01594 117 aa7.57□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 CD81P60033 236 aa7.57□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 TLE1Q04724 770 aa7.57□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 SPINK9Q5DT21 86 aa7.57□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 OR4A47Q6IF82 309 aa7.57□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM71F2Q6NXP2 309 aa7.57□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNIP4Q6PIL6 250 aa7.57□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa7.57□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF439Q8NDP4 499 aa7.57□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM204Q9BSN7 226 aa7.57□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM14BQ9NUH8 114 aa7.57□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa7.57□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa7.57□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 SPEGQ15772 3267 aa7.57□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF292O60281 2723 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC31A2O15432 143 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 CD99P14209 185 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 SRP14P37108 136 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 ERVFRD-1P60508 538 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 RHOBP62745 196 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM27E3Q08E93 113 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM177Q53S58 311 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 CT45A1Q5HYN5 189 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 TEPPQ6URK8 271 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 GFRALQ6UXV0 394 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 RPRMLQ8N4K4 120 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 CT45A3Q8NHU0 189 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 CCL13Q99616 98 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 PARLQ9H300 379 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 NPVFQ9HCQ7 196 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC35D1Q9NTN3 355 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 OR51B2Q9Y5P1 312 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa7.56□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A0G2JNJ9 132 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 C17orf100A8MU93 164 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 PAGE4O60829 102 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 GYPAP02724 150 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 CXCL1P09341 107 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 OR4A8P0C604 315 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 NDUFB7P17568 137 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 HOXA5P20719 270 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 IL3RAP26951 378 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 CCKARP32238 428 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 GALR1P47211 349 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 GNG10P50151 68 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 TDGF1P3P51864 188 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF134P52741 427 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 RPS16P62249 146 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 PRCDQ00LT1 54 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 SSX2Q16385 188 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF343Q6P1L6 599 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM216BQ8N7L0 139 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 C8orf31Q8N9H6 132 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF383Q8NA42 475 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 DEFB108BQ8NET1 73 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 OR5B3Q8NH48 314 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 OR4A5Q8NH83 315 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 VSTM2AQ8TAG5 236 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC35E1Q96K37 410 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF714Q96N38 554 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 GGTLC1Q9BX51 225 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 MS4A5Q9H3V2 200 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 SAP30LQ9HAJ7 183 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 BET1LQ9NYM9 111 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 Q9UFV3 132 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 MYO15AQ9UKN7 3530 aa7.55□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 PPIAL4EA0A075B759 164 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1W2PPE3 182 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 PRSS46E5RG02 174 aa7.54□□□□□ -1.2
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP5D1E7EU14 171 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.2 ms