RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587547.1

NEDD4L-218, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEDD4L, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-218ENST00000587547 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 SLC25A17O43808 307 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 GPR137BO60478 399 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 OR2F2O95006 317 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 DHFRP00374 187 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 HPRT1P00492 218 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 HRASP01112 189 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 IGLV2-23P01705 113 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 M6PRP20645 277 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 UCP1P25874 307 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 G6PCP35575 357 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 ERVK-16P61578 105 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 CD83Q01151 205 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 DHODHQ02127 395 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 DHRS2Q13268 280 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 EBI3Q14213 229 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 TMEM187Q14656 261 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 PSG5Q15238 335 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 ANKRD55Q3KP44 614 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 VMA21Q3ZAQ7 101 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF585BQ52M93 769 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 C9orf152Q5JTZ5 239 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 LIN54Q6MZP7 749 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 LYG2Q86SG7 212 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF695Q8IW36 515 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 TMEM86BQ8N661 226 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 Q8N6K4 173 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 DMBX1Q8NFW5 382 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 LHFPL5Q8TAF8 219 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 GLYATL2Q8WU03 294 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 CLCC1Q96S66 551 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 TMEM222Q9H0R3 208 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 FBXL15Q9H469 300 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 COMMD9Q9P000 198 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 KIAA1456Q9P272 454 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.69□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 RRHO14718 337 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 KRASP01116 189 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 IGKV1-39P01597 117 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 IGKV1D-39P04432 117 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 NQO2P16083 231 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 LGALS7P47929 136 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 AKR1C2P52895 323 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 SSTP61278 116 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 SLC51BQ86UW2 128 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 LGI3Q8N145 548 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 UXS1Q8NBZ7 420 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 GALNT14Q96FL9 552 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 RNF5Q99942 180 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 RASL11BQ9BPW5 248 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 PLSCR3Q9NRY6 295 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 TMEM140Q9NV12 185 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 C1RLQ9NZP8 487 aa6.68□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 MARCH11A6NNE9 402 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 CLDN34H7C241 214 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 PRAF2O60831 178 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 PFDN1O60925 122 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 ATG12O94817 140 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 SPDEFO95238 335 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 CDS2O95674 445 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 IGKV1-5P01602 117 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 IL5P05113 134 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 HOXB5P09067 269 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 CTRB1P17538 263 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 UBE2KP61086 200 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 GNB1P62873 340 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 SRPXP78539 464 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 OXA1LQ15070 435 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 OR4A47Q6IF82 309 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 SLC35G3Q8N808 338 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 Q8N9W7 124 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 MINDY2Q8NBR6 621 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 NPBQ8NG41 125 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 COQ8AQ8NI60 647 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 MRAPQ8TCY5 172 aa6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
NEDD4L-218ENST00000587547 CHPT1Q8WUD6 406 aa6.67□□□□□ -1.34
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