RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 PPOXP50336 477 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 PRRX1P54821 245 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 BRWD1-AS2P59051 145 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 SELENOVP59797 346 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 BPIFB3P59826 476 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 UBE2G2P60604 165 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 PRCDQ00LT1 54 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 AESQ08117 197 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 C2orf83Q53S99 150 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 CT83Q5H943 113 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 C9orf135Q5VTT2 229 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 SPINK14Q6IE38 97 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 WDR82Q6UXN9 313 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 Q6ZWC4 215 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 SSX8Q7RTT4 187 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 LRP11Q86VZ4 500 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 MRGPRDQ8TDS7 321 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 DDB2Q92466 427 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF714Q96N38 554 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 LINC00574Q9H8X3 128 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC35D1Q9NTN3 355 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 V9GYV3 84 aa6.4□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 GON4LQ3T8J9 2241 aa6.4□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1W2PN81 502 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM231BA6NCW3 169 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 LINC00473A8K010 186 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 LAMTOR5O43504 91 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 OR2J3O76001 311 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 IGLV1-44P01699 117 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 IGHG3P01860 377 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 CRYAAP02489 173 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 OR5AL1P0C617 328 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 OR9G9P0C7N8 305 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 LINC00869P0C866 280 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 C8orf88P0DMB2 117 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 TDGF1P13385 188 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 PRDX2P32119 198 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 MPV17P39210 176 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 REG1BP48304 166 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 AMTP48728 403 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.394e-6■■■□□ 16.6
CAPNS1-202ENST00000586851 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 CENPWQ5EE01 88 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 VSTM2AQ8TAG5 236 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 STARD4Q96DR4 205 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 LRFN3Q9BTN0 628 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 LPAR2Q9HBW0 351 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 BET1LQ9NYM9 111 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 DPRXA6NFQ7 191 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 APCSP02743 223 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 CBLN1P23435 193 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 CTRLP40313 264 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 IER3P46695 156 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 GUSBP1Q15486 140 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 PSMG4Q5JS54 123 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 MIC13Q5XKP0 118 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 STUMQ69YW2 141 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 C11orf53Q8IXP5 236 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 OR5T1Q8NG75 326 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 OR4P4Q8NGL7 312 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 OR13A1Q8NGR1 328 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 SARAFQ96BY9 339 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 C5orf30Q96GV9 206 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 TRIB1Q96RU8 372 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 TXN2Q99757 166 aa6.38□□□□□ -1.39
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CAPNS1-202ENST00000586851 DERL1Q9BUN8 251 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 MSL2Q9HCI7 577 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 NRN1Q9NPD7 142 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 CLCF1Q9UBD9 225 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 BRWD1Q9NSI6 2320 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 PCSK5Q92824 1860 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 M0R296 226 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 AQP7O14520 342 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 RRHO14718 337 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 APOA2P02652 100 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 IGLC2P0DOY2 106 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 IGLC3P0DOY3 106 aa6.37□□□□□ -1.39
CAPNS1-202ENST00000586851 IGHV1-2P23083 117 aa6.37□□□□□ -1.39
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