RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa22.99■■□□□ 1.27
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CTDNEP1-210ENST00000574322 IGLV2-23P01705 113 aa22.99■■□□□ 1.27
CTDNEP1-210ENST00000574322 LGALS7P47929 136 aa22.99■■□□□ 1.27
CTDNEP1-210ENST00000574322 DLX1P56177 255 aa22.99■■□□□ 1.27
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CTDNEP1-210ENST00000574322 PRCDQ00LT1 54 aa22.99■■□□□ 1.27
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
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CTDNEP1-210ENST00000574322 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa22.96■■□□□ 1.27
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM170AQ8WVE7 144 aa22.96■■□□□ 1.27
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CTDNEP1-210ENST00000574322 INSIG2Q9Y5U4 225 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDNEP1-210ENST00000574322 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa22.95■■□□□ 1.26
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CTDNEP1-210ENST00000574322 DLK1P80370 383 aa22.92■■□□□ 1.26
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CTDNEP1-210ENST00000574322 OR1L8Q8NGR8 309 aa22.92■■□□□ 1.26
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CTDNEP1-210ENST00000574322 DPM3Q9P2X0 92 aa22.92■■□□□ 1.26
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CTDNEP1-210ENST00000574322 NPY1RP25929 384 aa22.91■■□□□ 1.26
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CEACAM3P40198 252 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1-210ENST00000574322 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1-210ENST00000574322 MOB3BQ86TA1 216 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1-210ENST00000574322 RITA1Q96K30 269 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1-210ENST00000574322 SCRT1Q9BWW7 348 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1-210ENST00000574322 SIRPDQ9H106 197 aa22.9■■□□□ 1.26
CTDNEP1-210ENST00000574322 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
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