RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566882.5

CCNDBP1-210, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-210ENST00000566882 NQO2P16083 231 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 S100PP25815 95 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 LOXP28300 417 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 LINC00574Q9H8X3 128 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 LINC00312Q9Y6C7 94 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 PLXNB1O43157 2135 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR2C1O95371 312 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 MT-ND4LP03901 98 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 RAB4AP20338 218 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 FGF7P21781 194 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 CHRNB4P30926 498 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 RAB7AP51149 207 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 RAB5BP61020 215 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 DLK1P80370 383 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 ETFRF1Q6IPR1 90 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF429Q86V71 674 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR10P1Q8NGE3 313 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 NGBQ9NPG2 151 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 KIAA1456Q9P272 454 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 LAMP3Q9UQV4 416 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 CXCL1P09341 107 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 RAB11AP62491 216 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 DEFA6Q01524 100 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 FABP9Q0Z7S8 132 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 LFNGQ8NES3 379 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR4S2Q8NH73 311 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM216AQ8WUB2 273 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF714Q96N38 554 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 NEU1Q99519 415 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 HINT2Q9BX68 163 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 IFNA10P01566 189 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 ERVK-16P61578 105 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 MUC15Q8N387 334 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q8N7P7 452 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 GATAD1Q8WUU5 269 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC25A22Q9H936 323 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 TCF19Q9Y242 345 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 ITGB1BP1O14713 200 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 TCAPO15273 167 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 NDUFB3O43676 98 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 AGAP20933 346 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 TLE4Q04727 773 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF674Q2M3X9 581 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF787Q6DD87 383 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 C1orf87Q8N0U7 546 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM147Q9BVK8 224 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 MS4A5Q9H3V2 200 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 AKAP6Q13023 2319 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 C5orf52A6NGY3 159 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 FOLR2P14207 255 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 RPS10P46783 165 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 THBS3P49746 956 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 RHEBQ15382 184 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 HEPN1Q6WQI6 88 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 C11orf42Q8N5U0 333 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR13D1Q8NGV5 346 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q8WTZ3 238 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 CLUHP3Q96NS8 147 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 NPCDR1Q9BY65 106 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 NIT2Q9NQR4 276 aa8.28□□□□□ -1.08
CCNDBP1-210ENST00000566882 SMCO3A2RU48 225 aa8.27□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM41BQ5BJD5 291 aa8.27□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF506Q5JVG8 444 aa8.27□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGFBPL1Q8WX77 278 aa8.27□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 C1orf159Q96HA4 380 aa8.27□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 RITA1Q96K30 269 aa8.27□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 YPEL4Q96NS1 127 aa8.27□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR51M1Q9H341 326 aa8.27□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC35D1Q9NTN3 355 aa8.27□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 MIOXQ9UGB7 285 aa8.27□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa8.27□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 A0A1B0GW64 132 aa8.27□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 C15orf61A6NNL5 157 aa8.27□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 B9A039 149 aa8.27□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 PRSS46E5RG02 174 aa8.27□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC25A17O43808 307 aa8.27□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 MDKP21741 143 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 DLX6P56179 175 aa8.27□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 GNB2P62879 340 aa8.27□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 EFNB3Q15768 340 aa8.27□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa8.27□□□□□ -1.09
CCNDBP1-210ENST00000566882 LRRC10Q5BKY1 277 aa8.27□□□□□ -1.09
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