RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559557.1

MRPS11-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S11, human

TSL 3

Gene MRPS11, Length 447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPS11-208	ENST00000559557	RNLS	Q5VYX0	342 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	OR4A47	Q6IF82	309 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	OR10K2	Q6IF99	312 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	RAB12	Q6IQ22	244 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	NEK7	Q8TDX7	302 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	DCUN1D4	Q92564	292 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	GGH	Q92820	318 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	GHSR	Q92847	366 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	FAM46B	Q96A09	425 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	C5orf30	Q96GV9	206 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	LINC00167	Q96N53	147 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	NICN1	Q9BSH3	213 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	PARP11	Q9NR21	331 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		3.21	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	SNTN	A6NMZ2	147 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557		H0YJW9	148 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	FCN1	O00602	326 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	NBR2	O15453	112 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	TXNL1	O43396	289 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	RAMP3	O60896	148 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	PDCD6	O75340	191 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	BAG2	O95816	211 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	OR8U8	P0C7N1	319 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	GZMH	P20718	246 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	VDAC1	P21796	283 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	IL3RA	P26951	378 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	DCK	P27707	260 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	RAB9A	P51151	201 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	QRFP	P83859	136 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF616	Q08AN1	781 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	ST3GAL4	Q11206	333 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	ECSCR	Q19T08	205 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	C6orf183	Q5T699	404 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	NPB	Q8NG41	125 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	ARPC1A	Q92747	370 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557		Q96MT0	163 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	RCHY1	Q96PM5	261 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	OR51J1	Q9H342	316 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	FBXL15	Q9H469	300 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	GNG12	Q9UBI6	72 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	JPT1	Q9UK76	154 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	RYR1	P21817	5038 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	PKD1	P98161	4303 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	C3orf84	H3BNL1	204 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	OVOL1	O14753	267 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	SAP30	O75446	220 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	NAPSA	O96009	420 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	IGHV3-11	P01762	117 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	IGKV1-16	P04430	117 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	CT45A6	P0DMU7	189 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	CT45A5	P0DMU8	189 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	CT45A7	P0DMV0	189 aa		3.19	□□□□□ -1.9
MRPS11-208	ENST00000559557	MYL12A	P19105	171 aa		3.19	□□□□□ -1.9

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