RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 HACD4Q5VWC8 232 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 TPRA1Q86W33 373 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 NDUFA11Q86Y39 141 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 Q8N2B8 174 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 LFNGQ8NES3 379 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 OR5T1Q8NG75 326 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 CHPT1Q8WUD6 406 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 ARPC1AQ92747 370 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 SLC5A7Q9GZV3 580 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 ABCG5Q9H222 651 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 DIABLOQ9NR28 239 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 PLSCR3Q9NRY6 295 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 COA4Q9NYJ1 87 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 PIPOXQ9P0Z9 390 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 EXTL2Q9UBQ6 330 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 ANXA10Q9UJ72 324 aa3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 USP17L23D6RBM5 183 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 M0QZK8 103 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 SOX15O60248 233 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 PPYP01298 95 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 TRGV3P03979 118 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 CD37P11049 281 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 EDN2P20800 178 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 GALP22466 123 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 DTYMKP23919 212 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 HRH1P35367 487 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 RFX2P48378 723 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 THBS3P49746 956 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 CX3CL1P78423 397 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 CTF1Q16619 201 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 RTL8BQ17RB0 113 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 ACTBL2Q562R1 376 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 SPINK9Q5DT21 86 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 AADACL3Q5VUY0 350 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 CNIH2Q6PI25 160 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 PPP1R27Q86WC6 154 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF695Q8IW36 515 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM217Q8N7C4 229 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF645Q8N7E2 425 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 C8orf31Q8N9H6 132 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 OR4F17Q8NGA8 305 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 OR5H2Q8NGV7 314 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 MPLKIPQ8TAP9 179 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 MRAPQ8TCY5 172 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 SLC25A46Q96AG3 418 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 OR4F4Q96R69 305 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 AGMATQ9BSE5 352 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 HINT2Q9BX68 163 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 OR51J1Q9H342 316 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 HRASLSQ9HDD0 168 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 HSPB7Q9UBY9 170 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 MGAT4AQ9UM21 535 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 NSG2Q9Y328 171 aa3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 A0A087WW49 117 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 TRAV3A0A0B4J244 114 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 TRIM64CA6NLI5 447 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 H3BMQ9 156 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 RHODO00212 210 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 CTDSP2O14595 271 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 S1PR2O95136 353 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 NDUFA3O95167 84 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 DIRAS3O95661 229 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 IGLV2-23P01705 113 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 TRBV12-3P01733 135 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 HLA-DRB1P01911 266 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 OR5H8P0DN80 308 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 PGAM2P15259 253 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 DUTP33316 252 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 PRSS3P35030 304 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 TSPAN5P62079 268 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 IL18Q14116 193 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 EBI3Q14213 229 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 FXYD3Q14802 87 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 CDK10Q15131 360 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 VMA21Q3ZAQ7 101 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 ASPHD1Q5U4P2 390 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 FAM71F2Q6NXP2 309 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 TEX38Q6PEX7 206 aa3.31□□□□□ -1.88
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF554Q86TJ5 538 aa3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms