RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558379.5

TLE3-213, Transcript of transducin like enhancer of split 3, human

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TLE3, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TLE3-213	ENST00000558379	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
TLE3-213	ENST00000558379	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		10.21	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379		A0A1W2PPR1	153 aa		10.21	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		10.21	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		10.21	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	OPN1MW	P04001	364 aa		10.21	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		10.21	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		10.21	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	RAB2A	P61019	212 aa		10.21	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		10.21	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		10.21	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		10.21	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		10.21	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		10.21	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	TCF19	Q9Y242	345 aa		10.21	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	C15orf61	A6NNL5	157 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	UBE2C	O00762	179 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	TCAP	O15273	167 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	LY86	O95711	162 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	OR8U8	P0C7N1	319 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	MAJIN	Q3KP22	176 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	AVPI1	Q5T686	147 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	KIAA1456	Q9P272	454 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	DAO	P14920	347 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	KIR2DS2	P43631	304 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	UQCRFS1	P47985	274 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	GNB2	P62879	340 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	TLE4	Q04727	773 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	ICAM4	Q14773	271 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	VWC2	Q2TAL6	325 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	ZNF429	Q86V71	674 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	LFNG	Q8NES3	379 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379		A0A1B0GW64	132 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	PRSS46	E5RG02	174 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	IFNA10	P01566	189 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	MB	P02144	154 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	SOD3	P08294	240 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	FGF7	P21781	194 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	SERF2	P84101	59 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	OR52E5	Q8NH55	327 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	ABCA1	O95477	2261 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	CRYBA1	P05813	215 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	C1orf159	Q96HA4	380 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	KPTN	Q9Y664	436 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	USP24	Q9UPU5	2620 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	C5orf52	A6NGY3	159 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379		H0YJW9	148 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379		J3QR06	171 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	POU2AF1	Q16633	256 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	GNG13	Q9P2W3	67 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	BTBD17	A6NE02	478 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	CEBPG	P53567	150 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	AWAT1	Q58HT5	328 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	REC114	Q7Z4M0	266 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TLE3-213	ENST00000558379	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		10.17	□□□□□ -0.78

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms