RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 C2orf50Q96LR7 162 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 FAM157CP0CG43 387 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 TRAPPC2P0DI81 140 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 TRAPPC2BP0DI82 140 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 SLC25A6P12236 298 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 RPL8P62917 257 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 BLCAPP62952 87 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 PLGLAQ15195 96 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 FOXRED2Q8IWF2 684 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 OR8H1Q8NGG4 311 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 OR4A5Q8NH83 315 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 OR1S1Q8NH92 325 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 VSTM2AQ8TAG5 236 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 NEURL2Q9BR09 285 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 MAGT1Q9H0U3 335 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 COA4Q9NYJ1 87 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 GSKIPQ9P0R6 139 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 KIAA1456Q9P272 454 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 FBXO7Q9Y3I1 522 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 TEX22C9J3V5 150 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 H0YIZ8 118 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 FGF16O43320 207 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 GPR137BO60478 399 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 SNAPC5O75971 98 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 ATG12O94817 140 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 TMEM50AO95807 157 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 SCGB1D2O95969 90 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 HLA-DRB1P01911 266 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 GIPP09681 153 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 APELAP0DMC3 54 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 HILS1P60008 231 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 GNB1P62873 340 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 CX3CL1P78423 397 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 ID3Q02535 119 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 RAB32Q13637 225 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 TNXAQ16473 311 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 TMEM95Q3KNT9 176 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 ZNF429Q86V71 674 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 MMD2Q8IY49 270 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 OR4A16Q8NH70 328 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 MDFIQ99750 246 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 SPIN2AQ99865 258 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 NMES1Q9C002 83 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 RBKSQ9H477 322 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 C1RLQ9NZP8 487 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 HSPB7Q9UBY9 170 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 PRNDQ9UKY0 176 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 OR51B2Q9Y5P1 312 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 POMT1Q9Y6A1 747 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 BTBD17A6NE02 478 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 K7EPK0 472 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 CCNKO75909 580 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 IAPPP10997 89 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 AREGP15514 252 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 PAX9P55771 341 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 TNFRSF9Q07011 255 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 FXYD3Q14802 87 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 AKAP14Q86UN6 197 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 TMEM86BQ8N661 226 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 GRPEL2Q8TAA5 225 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-216ENST00000549221 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms