RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547310.1

LGR5-204, Transcript of leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 5, human

TSL 3

Gene LGR5, Length 576 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LGR5-204	ENST00000547310	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		2.76	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310		A0A0J9YXV3	536 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310		A0A1B0GW64	132 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	SCO1	O75880	301 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	NCR2	O95944	276 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	CXorf1	O96002	111 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	GPX1	P07203	203 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	PAEP	P09466	180 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310		P0DMU3	169 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	FAM231A	P0DMU4	169 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	FAM231C	P0DMU5	169 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	OR12D1	P0DN82	309 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	TDGF1	P13385	188 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	CRHBP	P24387	322 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	BRS3	P32247	399 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	ATP5G3	P48201	142 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	P2RX1	P51575	399 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	NDUFA8	P51970	172 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	GFER	P55789	205 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	DHRS2	Q13268	280 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	PPTC7	Q8NI37	304 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	PP6455	Q8WZ26	134 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	NMNAT3	Q96T66	252 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	MED9	Q9NWA0	146 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	KLK12	Q9UKR0	248 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	PHLPP1	O60346	1717 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	ADGRL2	O95490	1459 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	GRIN2A	Q12879	1464 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	TECPR2	O15040	1411 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	SCN2A	Q99250	2005 aa		2.75	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	CHD1	O14646	1710 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	FFAR1	O14842	300 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	TRBV12-3	P01733	135 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	OR4Q2	P0C623	313 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	NTF3	P20783	257 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	S100A2	P29034	98 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	CD70	P32970	193 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	TAS2R46	P59540	309 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	PPP1CA	P62136	330 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	ERCC8	Q13216	396 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	ZNF404	Q494X3	552 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	WDR59	Q6PJI9	974 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	LCN9	Q8WX39	176 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	SPACA5	Q96QH8	159 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	IMUP	Q9GZP8	106 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	MED28	Q9H204	178 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	RERGL	Q9H628	205 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	PLCH2	O75038	1416 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	ITGB4	P16144	1822 aa		2.73	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	MBD5	Q9P267	1494 aa		2.73	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		2.73	□□□□□ -1.97
LGR5-204	ENST00000547310	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		2.73	□□□□□ -1.97

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