RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545889.5

CLIP1-218, Transcript of CAP-Gly domain containing linker protein 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLIP1, Length 4,633 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-218ENST00000545889 BEND2Q8NDZ0 799 aa7.31□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 SLC25A38Q96DW6 304 aa7.31□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 HIGD1AQ9Y241 93 aa7.31□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa7.31□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 WISP1O95388 367 aa7.31□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 THBDP07204 575 aa7.31□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 COL8A1P27658 744 aa7.31□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 GNG4P50150 75 aa7.31□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 RIPPLY3P57055 190 aa7.31□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 RAB32Q13637 225 aa7.31□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa7.31□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa7.31□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 NTNG2Q96CW9 530 aa7.31□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 KCNK15Q9H427 330 aa7.31□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 EFNA2O43921 213 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 GCGP01275 180 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 PSG5Q15238 335 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 OR10G4Q8NGN3 311 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 OR10G9Q8NGN4 311 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 OR10G7Q8NGN6 311 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 PKIBQ9C010 78 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 CGB1A6NKQ9 187 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 H0YL77 283 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 CLDN34H7C241 214 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 IGKV3-20P01619 116 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 MMP9P14780 707 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 ZNF708P17019 499 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 WT1P19544 449 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 COMPP49747 757 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 FHITP49789 147 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 KRTDAPP60985 99 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 TMEM183BQ1AE95 376 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 ZNRF1Q8ND25 227 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 K7ERU9 68 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 TTRP02766 147 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 ZNF735P0CB33 412 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 ERVS71-1P61550 626 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 HIST1H3AP68431 136 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 DPPA3Q6W0C5 159 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 OR4P4Q8NGL7 312 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa7.3□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 C9JQL5 133 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 KLF4O43474 513 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 LYPD3O95274 346 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 SFT2D2O95562 160 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 VN1R17PQ8TDU5 208 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 WDYHV1Q96HA8 205 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 AMELYQ99218 206 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 LINC00470Q9BZP3 86 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 NPIPB6E9PJ23 425 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 LMX1BO60663 402 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 GZMBP10144 247 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 GALP22466 123 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 CD1BP29016 333 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 OR10J1P30954 320 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 PTGDSP41222 190 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 HEPN1Q6WQI6 88 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 OR2D3Q8NGH3 330 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 GALNT14Q96FL9 552 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 FER1L5A0AVI2 2057 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 B4DSR2 109 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 S1PR2O95136 353 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 CST4P01036 141 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 C19orf54Q5BKX5 351 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 OR1P1Q8NH06 330 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 LEAP2Q969E1 77 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 CEACAM18A8MTB9 384 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 K7ENP7 123 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 UBE2L6O14933 153 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 SPINK4O60575 86 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 EFNA4P52798 201 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 TEPPQ6URK8 271 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 ZNF524Q96C55 264 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 FUT9Q9Y231 359 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 SHANK1Q9Y566 2161 aa7.29□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 GTF3C1Q12789 2109 aa7.28□□□□□ -1.24
CLIP1-218ENST00000545889 ITGB1BP1O14713 200 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.6 ms