RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 BRD3OSQ6XYD6 125 aa7.95□□□□□ -1.14
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PTPRB-204ENST00000538708 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-204ENST00000538708 SLC25A15Q9Y619 301 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM14DPA8MWL7 114 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-204ENST00000538708 PAX1P15863 534 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-204ENST00000538708 ADIPOQQ15848 244 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-204ENST00000538708 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-204ENST00000538708 J3QR89 54 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-204ENST00000538708 CXCL3P19876 107 aa7.92□□□□□ -1.14
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