RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 XCL2Q9UBD3 114 aa7.17□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.16□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa7.16□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa7.16□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ST8SIA3O43173 380 aa7.16□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DFFBO76075 338 aa7.16□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KBTBD11O94819 623 aa7.16□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NUDT3O95989 172 aa7.16□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2B8PP59922 312 aa7.16□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ICAM4Q14773 271 aa7.16□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q56UQ5 140 aa7.16□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGSF11Q5DX21 431 aa7.16□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.16□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LILRB2Q8N423 598 aa7.16□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GGHQ92820 318 aa7.16□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.16□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AMBNQ9NP70 447 aa7.16□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.16□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 THYN1Q9P016 225 aa7.16□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CGB1A6NKQ9 187 aa7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AQP12BA6NM10 295 aa7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRDCB7Z8K6 153 aa7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 APOHP02749 345 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF688P0C7X2 276 aa7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLK9Q2XQG4 91 aa7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC25A24Q6NUK1 477 aa7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AQP12AQ8IXF9 295 aa7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARHGAP24Q8N264 748 aa7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR10J5Q8NHC4 309 aa7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ST8SIA2Q92186 375 aa7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF414Q96IQ9 312 aa7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADTRPQ96IZ2 230 aa7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DKK2Q9UBU2 259 aa7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLK9Q9UKQ9 250 aa7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.15□□□□□ -1.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A0A6YYD4 124 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SOCS1O15524 211 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IFNA5P01569 189 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCL18P55774 89 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARFRP1Q13795 201 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IRF3Q14653 427 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPSB3Q6PJ21 355 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GSG1LQ6UXU4 331 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VN1R17PQ8TDU5 208 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM59Q9BXS4 323 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q9H8V8 135 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C21orf62Q9NYP8 219 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MGAT4AQ9UM21 535 aa7.14□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRP2P98164 4655 aa7.13□□□□□ -1.27
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DCTN3O75935 186 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HLA-GP17693 338 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SRMP19623 302 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SERPINB10P48595 397 aa7.13□□□□□ -1.27
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPL8P62917 257 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q499Y3 187 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HSP90B2PQ58FF3 399 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCTD9Q7L273 389 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZFP41Q8N8Y5 198 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STXBP6Q8NFX7 210 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR10W1Q8NGF6 305 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VSTM2AQ8TAG5 236 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SCARB1Q8WTV0 552 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C12orf4Q9NQ89 552 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.13□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGLC7A0M8Q6 106 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SNTNA6NMZ2 147 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FABP7O15540 132 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CTSGP08311 255 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GNB3P16520 340 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MEDAGQ5VYS4 303 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SSX7Q7RTT5 188 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRRTM1Q86UE6 522 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DUSP18Q8NEJ0 188 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR52I1Q8NGK6 324 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR4A4PQ8NGN8 299 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAFIPQ8WZ33 124 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GINS4Q9BRT9 223 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GABARAPL3Q9BY60 117 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HRASLSQ9HDD0 168 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GHRLQ9UBU3 117 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa7.12□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa7.11□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM189A5PLL7 270 aa7.11□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LIMS3P0CW19 117 aa7.11□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LIMS4P0CW20 117 aa7.11□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FXYD7P58549 80 aa7.11□□□□□ -1.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DAD1P61803 113 aa7.11□□□□□ -1.27
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