RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531298.5

PACS1-211, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-211ENST00000531298 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa6.15□□□□□ -1.42
PACS1-211ENST00000531298 AKAP13Q12802 2813 aa6.15□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 PIEZO1Q92508 2521 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 C9JQL5 133 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 TGOLN2O43493 480 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 FCN3O75636 299 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 C1QL1O75973 258 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 IFNA10P01566 189 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 LIPFP07098 398 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 FHITP49789 147 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 ERVFRD-1P60508 538 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 RUNX1Q01196 453 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 ICAM4Q14773 271 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 HLA-DRB5Q30154 266 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 VMA21Q3ZAQ7 101 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 OR2B11Q5JQS5 317 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 TEPPQ6URK8 271 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 TMEM144Q7Z5S9 345 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 Q8N7P7 452 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 OR10X1Q8NGY0 326 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 MALSU1Q96EH3 234 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 SLC35E1Q96K37 410 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 RNF2Q99496 336 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 RSG1Q9BU20 258 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 CLEC7AQ9BXN2 247 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 DCAF16Q9NXF7 216 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 FAM96BQ9Y3D0 163 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 OR51B2Q9Y5P1 312 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 LOC400499M0QZD8 3231 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 ROS1P08922 2347 aa6.14□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 CEP295Q9C0D2 2601 aa6.13□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.13□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.13□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 A6NNC1 897 aa6.13□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 CORTO00230 105 aa6.13□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 SCO1O75880 301 aa6.13□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 MMP23AO75900 390 aa6.13□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 MT-ND4LP03901 98 aa6.13□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 FBP1P09467 338 aa6.13□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 IGFBP2P18065 325 aa6.13□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 FGF7P21781 194 aa6.13□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 RPL8P62917 257 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 ZNF726P1Q15940 193 aa6.13□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 LTC4SQ16873 150 aa6.13□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 OR8G2PQ6IF36 304 aa6.13□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 SSX9Q7RTT3 188 aa6.13□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa6.13□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa6.13□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 MMD2Q8IY49 270 aa6.13□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 ABHD12Q8N2K0 398 aa6.13□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.13□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.13□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.13□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 LINC01560Q8TB33 94 aa6.13□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 COMMD5Q9GZQ3 224 aa6.13□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.13□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 ZFHX4Q86UP3 3567 aa6.12□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.12□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.12□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 LY6LH3BQJ8 138 aa6.12□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 AGPAT2O15120 278 aa6.12□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 PDE6DO43924 150 aa6.12□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 VENTXO95231 258 aa6.12□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 MT-CO2P00403 227 aa6.12□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 STAG3L2P0CL84 134 aa6.12□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 STAG3L3P0CL85 134 aa6.12□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 CCL3L1P16619 93 aa6.12□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 TNCP24821 2201 aa6.12□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 CEACAM3P40198 252 aa6.12□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 NPBWR1P48145 328 aa6.12□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 SELENOTP62341 195 aa6.12□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 AKR1C1Q04828 323 aa6.12□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.12□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa6.12□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.12□□□□□ -1.43
PACS1-211ENST00000531298 ACSM6Q6P461 480 aa6.12□□□□□ -1.43
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