RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517170.1

RNU6-165P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 165, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-165P, Length 99 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-165P-201ENST00000517170 DOCK5Q9H7D0 1870 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 MYH11P35749 1972 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 HIVEP2P31629 2446 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 LTBP4Q8N2S1 1624 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 CUL9Q8IWT3 2517 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 KIF15Q9NS87 1388 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 SDK1Q7Z5N4 2213 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 TRGV2A0A075B6R0 118 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 PQLC2LA1A4F0 135 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 FUOMA2VDF0 154 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 FABP5P3A8MUU1 101 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 J3QKU1 62 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 LEPROTO15243 131 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 ATP5HO75947 161 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 HLA-DRB1P01911 266 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 PMP2P02689 132 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 PRM2P04554 102 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 S100A6P06703 90 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 MSMBP08118 114 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 TFPTP0C1Z6 253 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 METTL15P1P0C7V9 234 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 ZNF728P0DKX0 622 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 CCL3P10147 92 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 NEFHP12036 1026 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 IL9P15248 144 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 HLA-DMBP28068 263 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 CDKN2CP42773 168 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 DEFA1P59665 94 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 RAB14P61106 215 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 HBA1P69905 142 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 REEP5Q00765 189 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 AESQ08117 197 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 FOXF1Q12946 379 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 PMAIP1Q13794 54 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 TMED2Q15363 201 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 HIST3H3Q16695 136 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 TMEM155Q4W5P6 130 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 TMEM42Q69YG0 159 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 Q6ZTI0 123 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 OOSP2Q86WS3 158 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 GPHB5Q86YW7 130 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 C20orf196Q8IYI0 205 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 ZNF439Q8NDP4 499 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 OR4E2Q8NGC2 313 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 ITFG2Q969R8 447 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 SCGB3A1Q96QR1 104 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 SERPINI1Q99574 410 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 Q9BRP9 147 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 UPK3BQ9BT76 320 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 TIMM21Q9BVV7 248 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 OR51V1Q9H2C8 321 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 EFCAB1Q9HAE3 211 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 IL36BQ9NZH7 164 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 FUT9Q9Y231 359 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 PKIGQ9Y2B9 76 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 TIMM22Q9Y584 194 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 MICAL3Q7RTP6 2002 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 FN1P02751 2386 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 MYOFQ9NZM1 2061 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 CACNA1GO43497 2377 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 PTPRSQ13332 1948 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 PXDNLA1KZ92 1463 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 SIPA1L1O43166 1804 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 FLT4P35916 1363 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 TRAV7A0A075B6U4 112 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 A0A0D9SG52 128 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 A0A0G2JQZ4 141 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 A0A0J9YY10 115 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 MUC21A0A140T8X8 626 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 A0A1B0GX78 115 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 MEIS3P1A6NDR6 274 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 OR4C46A6NHA9 309 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-165P-201ENST00000517170 TMEM114B3SHH9 223 aa0.62□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms