RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514625.1

FAAP20-215, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 3

Gene FAAP20, Length 703 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-215	ENST00000514625	BRI3	O95415	125 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	RUNX1	Q01196	453 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	OR11H1	Q8NG94	326 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	DPF1	Q92782	380 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625		H0Y980	276 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625		I3L521	148 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	FGF2	P09038	288 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	G6PC	P35575	357 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	ZNF79	Q15937	498 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	CADM3	Q8N126	398 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		13.9	□□□□□ -0.18
FAAP20-215	ENST00000514625	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	HMX3	A6NHT5	357 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625		G3V4G9	280 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	B3GALNT1	O75752	331 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	IGHV3-11	P01762	117 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	OR8U8	P0C7N1	319 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	ZNF616	Q08AN1	781 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	C1QL4	Q86Z23	238 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	TRIM63	Q969Q1	353 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	USMG5	Q96IX5	58 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	TSC22D3	Q99576	134 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		13.89	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	TNC	P24821	2201 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	TEX22	C9J3V5	150 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	ATG12	O94817	140 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	DHFR	P00374	187 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	IGLL1	P15814	213 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	INPP1	P49441	399 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	GPR132	Q9UNW8	380 aa		13.88	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625		E7EUB6	86 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	MYOD1	P15172	320 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	OR2B8P	P59922	312 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	FHL3	Q13643	280 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	TRIM16L	Q309B1	348 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	SEC22A	Q96IW7	307 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	TP53RK	Q96S44	253 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	SRR	Q9GZT4	340 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	PRND	Q9UKY0	176 aa		13.87	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	FAM223B	A6NKX1	122 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	LINC01619	G3V211	115 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	PSMB6	P28072	239 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	DEFA6	Q01524	100 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	TRIQK	Q629K1	86 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	OR4A16	Q8NH70	328 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		13.86	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625		A0A1B0GW64	132 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	IGKV1-39	P01597	117 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	PRH1	P02810	166 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	IGKV1D-39	P04432	117 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	DEFA4	P12838	97 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	AREG	P15514	252 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	AKR1C2	P52895	323 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	RHOG	P84095	191 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	ATP5G2	Q06055	141 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	SP6	Q3SY56	376 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	NECAP1	Q8NC96	275 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	HINT2	Q9BX68	163 aa		13.85	□□□□□ -0.19
FAAP20-215	ENST00000514625	NAA60	Q9H7X0	242 aa		13.85	□□□□□ -0.19

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