RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512131.5

SH3BP2-223, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131		A0A1B0GW64	132 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131		A6NHS1	94 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	PF4	P02776	101 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	PGAM2	P15259	253 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	ECI1	P42126	302 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR5T1	Q8NG75	326 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	GPR132	Q9UNW8	380 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SH3BP2-223	ENST00000512131	CGB1	A6NKQ9	187 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	TEX22	C9J3V5	150 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	CCL24	O00175	119 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGKV1-39	P01597	117 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGKV1D-39	P04432	117 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR9G9	P0C7N8	305 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	HLA-G	P17693	338 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	CD40LG	P29965	261 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	FHL3	Q13643	280 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		13.39	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131		H0Y980	276 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRAS	P01116	189 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	APELA	P0DMC3	54 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	ERVK-16	P61578	105 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	DEFB136	Q30KP8	78 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	SEC22A	Q96IW7	307 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	MS4A10	Q96PG2	267 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	PHB2	Q99623	299 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRGV3	P03979	118 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	MYOD1	P15172	320 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	RPA2	P15927	270 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	G6PC	P35575	357 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	TPPP2	P59282	170 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	AP3S2	P59780	193 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR2B8P	P59922	312 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	KLK9	Q2XQG4	91 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	DUX3	Q96PT4	197 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	TP53RK	Q96S44	253 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	COPZ2	Q9P299	210 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	HMX3	A6NHT5	357 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	B3GALNT1	O75752	331 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	CRYGC	P07315	174 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	CD33	P20138	364 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	UCP1	P25874	307 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR11H1	Q8NG94	326 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		13.36	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131		K7EIL1	84 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	SERPINE2	P07093	398 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF45	Q02386	682 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	BAK1	Q16611	211 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR5B12	Q96R08	314 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	MCUB	Q9NWR8	336 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	COA4	Q9NYJ1	87 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131		A0A0G2JLM5	398 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131		P0C879	139 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	AREG	P15514	252 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGLL1	P15814	213 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	USMG5	Q96IX5	58 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	TSC22D3	Q99576	134 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	SNAPC5	O75971	98 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	CDS2	O95674	445 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGHV3-11	P01762	117 aa		13.33	□□□□□ -0.28

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