RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 S4R3C0 116 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 NPIPB5A8MRT5 1133 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 PI3P19957 117 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 G6PCP35575 357 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 LPAR6P43657 344 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 DEFB121Q5J5C9 76 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 LHFPL1Q86WI0 220 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 CMTM1Q8IZ96 169 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 USMG5Q96IX5 58 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC2A9Q9NRM0 540 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 NSG2Q9Y328 171 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 CEPT1Q9Y6K0 416 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 IGLC7A0M8Q6 106 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM223BA6NKX1 122 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 BMPR1BO00238 502 aa14.31□□□□□ -0.12
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SH3BP2-218ENST00000511185 IGHV3-23P01764 117 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 IGKV1D-39P04432 117 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 PSMB6P28072 239 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 SYNJ2BPP57105 145 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 C15orf32Q32M92 178 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM223AQ8IWN6 122 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC38A6Q8IZM9 456 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 CD300LFQ8TDQ1 290 aa14.31□□□□□ -0.12
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SH3BP2-218ENST00000511185 FANCD2OSQ96PS1 177 aa14.31□□□□□ -0.12
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SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 DMRT1Q9Y5R6 373 aa14.31□□□□□ -0.12
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SH3BP2-218ENST00000511185 PPP5D1E7EU14 171 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 NOL3O60936 208 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
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SH3BP2-218ENST00000511185 CTRB2Q6GPI1 263 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF429Q86V71 674 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 OR10W1Q8NGF6 305 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 SMIM4Q8WVI0 70 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC140Q96MF4 163 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 GABARAPH6UMI1 98 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 NDUFB8O95169 186 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 LY86O95711 162 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 CRYGCP07315 174 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 SPNP16150 400 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 INSL3P51460 131 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 UCP3P55916 312 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 ERVK-16P61578 105 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP5G2Q06055 141 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 IL18Q14116 193 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 C11orf87Q6NUJ2 197 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM229BQ8NBD8 167 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 NECAP1Q8NC96 275 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 DIRAS2Q96HU8 199 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXL7Q9UJT9 491 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa14.28□□□□□ -0.12
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SH3BP2-218ENST00000511185 TPPPO94811 219 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 PGAM2P15259 253 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 EDN2P20800 178 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 TAS2R19P59542 299 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 IL34Q6ZMJ4 242 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC25A42Q86VD7 318 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 ARRDC1Q8N5I2 433 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP2-218ENST00000511185 AIFM2Q9BRQ8 373 aa14.28□□□□□ -0.12
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SH3BP2-218ENST00000511185 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
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SH3BP2-218ENST00000511185 WT1-ASQ06250 92 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP2-218ENST00000511185 RPEL1Q2QD12 228 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP2-218ENST00000511185 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP2-218ENST00000511185 STEAP1BQ6NZ63 245 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP2-218ENST00000511185 OR9G4Q8NGQ1 327 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP2-218ENST00000511185 OR13C8Q8NGS7 320 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP2-218ENST00000511185 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
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SH3BP2-218ENST00000511185 RAB3DO95716 219 aa14.26□□□□□ -0.13
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SH3BP2-218ENST00000511185 LPCAT3Q6P1A2 487 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP2-218ENST00000511185 OR4C16Q8NGL9 310 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP2-218ENST00000511185 MARCH1Q8TCQ1 289 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP2-218ENST00000511185 C15orf40Q8WUR7 153 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP2-218ENST00000511185 SEC22AQ96IW7 307 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP2-218ENST00000511185 OR4C12Q96R67 309 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP2-218ENST00000511185 TP53RKQ96S44 253 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP2-218ENST00000511185 B9D2Q9BPU9 175 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP2-218ENST00000511185 C15orf61A6NNL5 157 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP2-218ENST00000511185 IGLV1-51P01701 117 aa14.25□□□□□ -0.13
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