RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 DLK1P80370 383 aa8.76□□□□□ -1.01
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SH3BP2-209ENST00000504450 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa8.75□□□□□ -1.01
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SH3BP2-209ENST00000504450 NPCDR1Q9BY65 106 aa8.74□□□□□ -1.01
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SH3BP2-209ENST00000504450 REG1BP48304 166 aa8.73□□□□□ -1.01
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SH3BP2-209ENST00000504450 LCN15Q6UWW0 184 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP2-209ENST00000504450 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
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SH3BP2-209ENST00000504450 WASHC3Q9Y3C0 194 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP2-209ENST00000504450 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SH3BP2-209ENST00000504450 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SH3BP2-209ENST00000504450 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1W2PPH5 198 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP2-209ENST00000504450 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP2-209ENST00000504450 A6NNC1 897 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP2-209ENST00000504450 SEC14L6B5MCN3 397 aa8.72□□□□□ -1.01
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