RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 RAB9AP51151 201 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 DEFB136Q30KP8 78 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 SP6Q3SY56 376 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 TMEM65Q6PI78 240 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 ZNF695Q8IW36 515 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 GDPD1Q8N9F7 314 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 OR5M8Q8NGP6 311 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 OR4A5Q8NH83 315 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 TMEM230Q96A57 120 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 MS4A10Q96PG2 267 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 DUX3Q96PT4 197 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 GNB4Q9HAV0 340 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 NSG2Q9Y328 171 aa6.73□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 PLXNB1O43157 2135 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 PF4P02776 101 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 OR5AC1P0C628 307 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 HLA-GP17693 338 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 MAS1LP35410 378 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 FAUP35544 74 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 TPPP2P59282 170 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 AP3S2P59780 193 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 ERVK-16P61578 105 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 RPL8P62917 257 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 DEFA5Q01523 94 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 ZNF45Q02386 682 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 TRIQKQ629K1 86 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 SEC22AQ96IW7 307 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 TMEM68Q96MH6 324 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 OR5B12Q96R08 314 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 NAA60Q9H7X0 242 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa6.72□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PKP4-216ENST00000495123 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 DBX1A6NMT0 343 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 IGKV1-5P01602 117 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 IGHV3-11P01762 117 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 PRH1P02810 166 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 TRGV3P03979 118 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 SERPINE2P07093 398 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 IL7P13232 177 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 AREGP15514 252 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 UCP1P25874 307 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 OR2B8PP59922 312 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 LHFPL5Q8TAF8 219 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 RAX2Q96IS3 184 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 P2RX4Q99571 388 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 SPIN2AQ99865 258 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 BATF3Q9NR55 127 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 COA4Q9NYJ1 87 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 PTTG2Q9NZH5 202 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 A0A0G2JRQ6 117 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 H3BUA1 57 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 I3L521 148 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 CCL24O00175 119 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 REG1AP05451 166 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 P0C879 139 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 CD40LGP29965 261 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 SLC6A1P30531 599 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 MYCNOSP40205 109 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 INPP1P49441 399 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 CCR6P51684 374 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 TRIM16LQ309B1 348 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 CADM3Q8N126 398 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 OR11H1Q8NG94 326 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 GLYATL2Q8WU03 294 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 DEDD2Q8WXF8 326 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 SCGB3A2Q96PL1 93 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 COMMD5Q9GZQ3 224 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 SLA2Q9H6Q3 261 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 PRR13Q9NZ81 148 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 OR51B2Q9Y5P1 312 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 C15orf61A6NNL5 157 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-216ENST00000495123 NPIPB5A8MRT5 1133 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.6 ms