RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 OR3A1P47881 315 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 GNB2P62879 340 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 LCN2P80188 198 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 COL10A1Q03692 680 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 OR8G2PQ6IF36 304 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 SPNS3Q6ZMD2 512 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 C5orf24Q7Z6I8 188 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 PRR18Q8N4B5 295 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 OR10G9Q8NGN4 311 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 OR10G7Q8NGN6 311 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 FRZBQ92765 325 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 SDSLQ96GA7 329 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 COQ2Q96H96 371 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 SNX22Q96L94 193 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 IMMP2LQ96T52 175 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 OR2D2Q9H210 308 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 RAB9BQ9NP90 201 aa7.93□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 C19orf84I3L1E1 186 aa7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 FSTL3O95633 263 aa7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 TYMSP04818 313 aa7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 SOD3P08294 240 aa7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 FABP4P15090 132 aa7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 CCL8P80075 99 aa7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 ESPL1Q14674 2120 aa7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 FFAR4Q5NUL3 377 aa7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 STUMQ69YW2 141 aa7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 C11orf71Q6IPW1 123 aa7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 C16orf82Q7Z2V1 217 aa7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM170AQ8WVE7 144 aa7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 RAB1CQ92928 201 aa7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 LURAP1Q96LR2 239 aa7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 PARLQ9H300 379 aa7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 VSIRQ9H7M9 311 aa7.92□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 CACNA1DQ01668 2161 aa7.91□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 CELSR2Q9HCU4 2923 aa7.91□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 ODAMA1E959 279 aa7.91□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 C12orf77C9JDV5 145 aa7.91□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM178BH3BS89 294 aa7.91□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 PHOX2AO14813 284 aa7.91□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 SPINT2O43291 252 aa7.91□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 GGCTO75223 188 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 TFF1P04155 84 aa7.91□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 PFN1P07737 140 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 CGB3P0DN86 165 aa7.91□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 CGB7P0DN87 165 aa7.91□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 KIR2DS2P43631 304 aa7.91□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 SSTP61278 116 aa7.91□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 HTD2P86397 168 aa7.91□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa7.91□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 AARDQ4LEZ3 155 aa7.91□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 FAM201AQ5SY85 155 aa7.91□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF788Q6ZQV5 615 aa7.91□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 SSX7Q7RTT5 188 aa7.91□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 MUC15Q8N387 334 aa7.91□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 OR1P1Q8NH06 330 aa7.91□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 ABHD5Q8WTS1 349 aa7.91□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.91□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.91□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 GPR61Q9BZJ8 451 aa7.91□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 SLC25A22Q9H936 323 aa7.91□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 DCAF16Q9NXF7 216 aa7.91□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 PLCE1Q9P212 2302 aa7.91□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 GAB2Q9UQC2 676 aa7.91□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 ABCA12Q86UK0 2595 aa7.9□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.9□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 A0A1W2PPR1 153 aa7.9□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 MGST3O14880 152 aa7.9□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 TMPRSS2O15393 492 aa7.9□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP7.9□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 KRASP01116 189 aa7.9□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 GCGP01275 180 aa7.9□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 HBZP02008 142 aa7.9□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 GYPAP02724 150 aa7.9□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 PPOXP50336 477 aa7.9□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 PDLIM4P50479 330 aa7.9□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 ERVK-16P61578 105 aa7.9□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 AESQ08117 197 aa7.9□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 ACSM6Q6P461 480 aa7.9□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 REC114Q7Z4M0 266 aa7.9□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 DTX2Q86UW9 622 aa7.9□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 OR51G1Q8NGK1 321 aa7.9□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 OR2T10Q8NGZ9 312 aa7.9□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 OR4F5Q8NH21 305 aa7.9□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 OR4X1Q8NH49 305 aa7.9□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 OR52E5Q8NH55 327 aa7.9□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 PPP1R35Q8TAP8 253 aa7.9□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 RAB24Q969Q5 203 aa7.9□□□□□ -1.14
POLR1A-208ENST00000486964 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms