RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 CD8AP01732 235 aa11.52□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 APELAP0DMC3 54 aa11.52□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 PLAURQ03405 335 aa11.52□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa11.52□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 SSC4DQ8WTU2 575 aa11.52□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 HELTA6NFD8 242 aa11.51□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 H0YL77 283 aa11.51□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 ZG16O60844 167 aa11.51□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 CDKN1AP38936 164 aa11.51□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 GLIPR1P48060 266 aa11.51□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 LYZL4Q96KX0 146 aa11.51□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 PAXXQ9BUH6 204 aa11.51□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 TMEM140Q9NV12 185 aa11.51□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 SPRR3Q9UBC9 169 aa11.51□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 UFC1Q9Y3C8 167 aa11.51□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa11.51□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 KBTBD11O94819 623 aa11.51□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 FHL1Q13642 323 aa11.51□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa11.51□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 UQCR10Q9UDW1 63 aa11.51□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 HKR1P10072 659 aa11.51□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 COL8A1P27658 744 aa11.51□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 C1QL1O75973 258 aa11.51□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 EFNA4P52798 201 aa11.51□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 PRSS22Q9GZN4 317 aa11.51□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 OR5AL1P0C617 328 aa11.5□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 HOXA5P20719 270 aa11.5□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 PSG9Q00887 426 aa11.5□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 TMEM187Q14656 261 aa11.5□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa11.5□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 BCL2P10415 239 aa11.5□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 HTN1P15515 57 aa11.5□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 RPL7P18124 248 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 GGNQ86UU5 652 aa11.5□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 DUX5Q96PT3 197 aa11.5□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 ICE1Q9Y2F5 2266 aa11.5□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 CACNA1DQ01668 2161 aa11.5□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 IER3P46695 156 aa11.5□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 PSG7Q13046 419 aa11.5□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 FGFRL1Q8N441 504 aa11.5□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 CA7P43166 264 aa11.5□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 SERF2P84101 59 aa11.5□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 ZNF146Q15072 292 aa11.5□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 HIST3H3Q16695 136 aa11.5□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 TMEM97Q5BJF2 176 aa11.5□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 SAMD13Q5VXD3 122 aa11.5□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 SNURFLB1AK76 121 aa11.49□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 NPPCP23582 126 aa11.49□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 TXNDC17Q9BRA2 123 aa11.49□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 UBE2CO00762 179 aa11.49□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 RHBDL1O75783 438 aa11.49□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 GCSHP23434 173 aa11.49□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 Q0VFX4 171 aa11.49□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 TMEM183AQ8IXX5 376 aa11.49□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa11.49□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 GPR146Q96CH1 333 aa11.49□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa11.49□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 E9PQ18 207 aa11.49□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 C2orf68Q2NKX9 166 aa11.49□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 WBP1Q96G27 269 aa11.49□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 RARRES2Q99969 163 aa11.49□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 GAGE10A6NGK3 116 aa11.49□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 TRGV3P03979 118 aa11.49□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 RUNX1Q01196 453 aa11.49□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 TUBA4BQ9H853 241 aa11.49□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 FANCMQ8IYD8 2048 aa11.49□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 MDS2Q8NDY4 140 aa11.48□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 SOD3P08294 240 aa11.48□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 TFPI2P48307 235 aa11.48□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 TCL1AP56279 114 aa11.48□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 HCP5Q6MZN7 132 aa11.48□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 PEMTQ9UBM1 199 aa11.48□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 SCN8AQ9UQD0 1980 aa11.48□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa11.48□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 PAGE4O60829 102 aa11.48□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 PLA2G2CQ5R387 149 aa11.48□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 NABP1Q96AH0 204 aa11.48□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 C19orf24Q9BVV8 132 aa11.48□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 HELZP42694 1942 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa11.48□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 SCGB1C2P0DMR2 95 aa11.48□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 CRYGSP22914 178 aa11.48□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 LINC00869P0C866 280 aa11.47□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 CAMPP49913 170 aa11.47□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 FAM89BQ8N5H3 189 aa11.47□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 ZNRF1Q8ND25 227 aa11.47□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 J3QKU1 62 aa11.47□□□□□ -0.57
NISCH-207ENST00000479054 MOSP00540 346 aa11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms