RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 KBTBD11O94819 623 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 SIX6O95475 246 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 CRYZL1O95825 349 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 MOSP00540 346 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 IGHV1-69P01742 117 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 IGHV3-7P01780 117 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 P0C879 139 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 COX7A1P24310 79 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 F2RL1P55085 397 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 ERHP84090 104 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 BAXQ07812 192 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 ATP6V1FQ16864 119 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 SHISA2Q6UWI4 295 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 LHFPL5Q8TAF8 219 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 LEAP2Q969E1 77 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM68Q96MH6 324 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 TBX15Q96SF7 602 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 RNF126Q9BV68 326 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 COMMD5Q9GZQ3 224 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 MFFQ9GZY8 342 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 SIRT7Q9NRC8 400 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 KIAA1456Q9P272 454 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 HSPB7Q9UBY9 170 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 PITPNC1Q9UKF7 332 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa5.66□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 A0A1W2PN81 502 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 M0QZK8 103 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 UPK2O00526 184 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 CYB5BO43169 146 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 CHST1O43916 411 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 RAMP3O60896 148 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 TSC22D2O75157 780 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 JTBO76095 146 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 S1PR2O95136 353 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 IFNA17P01571 189 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 IGKV1-39P01597 117 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 MBPP02686 304 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 IGKV1D-39P04432 117 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 FBP1P09467 338 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 S100A11P31949 105 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 G6PCP35575 357 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 CHRNA7P36544 502 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 BRWD1-AS2P59051 145 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 RAB11AP62491 216 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 TNFRSF9Q07011 255 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 RAB32Q13637 225 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 C2orf68Q2NKX9 166 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 HCP5Q6MZN7 132 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 C16orf82Q7Z2V1 217 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 MMD2Q8IY49 270 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 OR2C3Q8N628 320 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 NPBQ8NG41 125 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 OR1L6Q8NGR2 347 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 OR1L8Q8NGR8 309 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 HARBI1Q96MB7 349 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 AQP10Q96PS8 301 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 JMJD8Q96S16 334 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM140Q9NV12 185 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 CACNG5Q9UF02 275 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 TNFSF18Q9UNG2 199 aa5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SHQ1-207ENST00000475558 TGP01266 2768 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1-207ENST00000475558 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1-207ENST00000475558 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1-207ENST00000475558 CEBPZOSA8MTT3 80 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1-207ENST00000475558 CCSO14618 274 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1-207ENST00000475558 SOX15O60248 233 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1-207ENST00000475558 DFFBO76075 338 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1-207ENST00000475558 IGKV1-5P01602 117 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1-207ENST00000475558 RPL12P30050 165 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
SHQ1-207ENST00000475558 S100A10P60903 97 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1-207ENST00000475558 RPL8P62917 257 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
SHQ1-207ENST00000475558 HBG1P69891 147 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1-207ENST00000475558 HBG2P69892 147 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1-207ENST00000475558 SSX2Q16385 188 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1-207ENST00000475558 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
SHQ1-207ENST00000475558 PRR31Q5SQ13 230 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1-207ENST00000475558 OR4A47Q6IF82 309 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1-207ENST00000475558 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
SHQ1-207ENST00000475558 C9orf139Q6ZV77 190 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1-207ENST00000475558 PPP1R27Q86WC6 154 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1-207ENST00000475558 STX12Q86Y82 276 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1-207ENST00000475558 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1-207ENST00000475558 KCNRGQ8N5I3 272 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1-207ENST00000475558 DCUN1D4Q92564 292 aa5.64□□□□□ -1.51
SHQ1-207ENST00000475558 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
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