RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 PHLDA2Q53GA4 152 aa14.67□□□□□ -0.06
SYF2-203ENST00000474160 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SYF2-203ENST00000474160 TBC1D26Q86UD7 250 aa14.67□□□□□ -0.06
SYF2-203ENST00000474160 DEDD2Q8WXF8 326 aa14.67□□□□□ -0.06
SYF2-203ENST00000474160 MS4A10Q96PG2 267 aa14.67□□□□□ -0.06
SYF2-203ENST00000474160 TSC22D3Q99576 134 aa14.67□□□□□ -0.06
SYF2-203ENST00000474160 TMEM140Q9NV12 185 aa14.67□□□□□ -0.06
SYF2-203ENST00000474160 FAM223BA6NKX1 122 aa14.66□□□□□ -0.06
SYF2-203ENST00000474160 LPAR6P43657 344 aa14.66□□□□□ -0.06
SYF2-203ENST00000474160 ZNF585BQ52M93 769 aa14.66□□□□□ -0.06
SYF2-203ENST00000474160 FAM223AQ8IWN6 122 aa14.66□□□□□ -0.06
SYF2-203ENST00000474160 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa14.66□□□□□ -0.06
SYF2-203ENST00000474160 DUX3Q96PT4 197 aa14.66□□□□□ -0.06
SYF2-203ENST00000474160 PRRT1Q99946 306 aa14.66□□□□□ -0.06
SYF2-203ENST00000474160 COMMD5Q9GZQ3 224 aa14.66□□□□□ -0.06
SYF2-203ENST00000474160 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SYF2-203ENST00000474160 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa14.65□□□□□ -0.06
SYF2-203ENST00000474160 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa14.65□□□□□ -0.06
SYF2-203ENST00000474160 DPPA5A6NC42 116 aa14.65□□□□□ -0.06
SYF2-203ENST00000474160 TEX22C9J3V5 150 aa14.65□□□□□ -0.06
SYF2-203ENST00000474160 CRYGCP07315 174 aa14.65□□□□□ -0.06
SYF2-203ENST00000474160 INSL3P51460 131 aa14.65□□□□□ -0.06
SYF2-203ENST00000474160 RAB25P57735 213 aa14.65□□□□□ -0.06
SYF2-203ENST00000474160 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa14.65□□□□□ -0.06
SYF2-203ENST00000474160 KLK9Q2XQG4 91 aa14.65□□□□□ -0.06
SYF2-203ENST00000474160 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SYF2-203ENST00000474160 C9orf66Q5T8R8 295 aa14.65□□□□□ -0.06
SYF2-203ENST00000474160 SLC2A8Q9NY64 477 aa14.65□□□□□ -0.06
SYF2-203ENST00000474160 FKBP11Q9NYL4 201 aa14.65□□□□□ -0.06
SYF2-203ENST00000474160 KLK9Q9UKQ9 250 aa14.65□□□□□ -0.06
SYF2-203ENST00000474160 H0Y980 276 aa14.64□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 SNAPC5O75971 98 aa14.64□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 ATG12O94817 140 aa14.64□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 ZP3P21754 424 aa14.64□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 PIGPP57054 158 aa14.64□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 AP3S2P59780 193 aa14.64□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa14.64□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 C10orf55Q5SWW7 151 aa14.64□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 FOXB2Q5VYV0 432 aa14.64□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 NECAP1Q8NC96 275 aa14.64□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 OR4D10Q8NGI6 311 aa14.64□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 CASTOR1Q8WTX7 329 aa14.64□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 OR5B12Q96R08 314 aa14.64□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 COPZ2Q9P299 210 aa14.64□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa14.64□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 SERPINE2P07093 398 aa14.63□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 PSMB6P28072 239 aa14.63□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 FAUP35544 74 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 ETV6P41212 452 aa14.63□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 OR2B8PP59922 312 aa14.63□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 ZNF343Q6P1L6 599 aa14.63□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 OR4C16Q8NGL9 310 aa14.63□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 SCGB3A2Q96PL1 93 aa14.63□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 PRNDQ9UKY0 176 aa14.63□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 CYB5BO43169 146 aa14.62□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 KRASP01116 189 aa14.62□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 IGHV3-11P01762 117 aa14.62□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 CTRB1P17538 263 aa14.62□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 PPP5CP53041 499 aa14.62□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 SPANXN2Q5MJ10 180 aa14.62□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 CTRB2Q6GPI1 263 aa14.62□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 CCDC190Q86UF4 302 aa14.62□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 OR1L8Q8NGR8 309 aa14.62□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 OR13C8Q8NGS7 320 aa14.62□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 OR5B3Q8NH48 314 aa14.62□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa14.61□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 A0A087WW49 117 aa14.61□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 HMX3A6NHT5 357 aa14.61□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 OVOL1O14753 267 aa14.61□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 APELAP0DMC3 54 aa14.61□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 G6PCP35575 357 aa14.61□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 RHOGP84095 191 aa14.61□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 SEC22AQ96IW7 307 aa14.61□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 V9GYH0 126 aa14.61□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa14.6□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 A0A1B0GW64 132 aa14.6□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 SEC14L6B5MCN3 397 aa14.6□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 E7EUB6 86 aa14.6□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 TRAPPC2P0DI81 140 aa14.6□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 TRAPPC2BP0DI82 140 aa14.6□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 ATP5G2Q06055 141 aa14.6□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 PYDC2Q56P42 97 aa14.6□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa14.6□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 Q8N402 240 aa14.6□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 GDPD1Q8N9F7 314 aa14.6□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 MARCH1Q8TCQ1 289 aa14.6□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 AKIP1Q9NQ31 210 aa14.6□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 THYN1Q9P016 225 aa14.6□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 TRAV3A0A0B4J244 114 aa14.59□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 IGLC7A0M8Q6 106 aa14.59□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 CGB1A6NKQ9 187 aa14.59□□□□□ -0.07
SYF2-203ENST00000474160 C15orf61A6NNL5 157 aa14.59□□□□□ -0.07
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