RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472032.1

BBX-222, Transcript of BBX, HMG-box containing, human

TSL 4

Gene BBX, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBX-222	ENST00000472032	RPEL1	Q2QD12	228 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	STUM	Q69YW2	141 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032		Q6ZVH6	145 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	TCF24	Q7RTU0	167 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	OR1L3	Q8NH93	324 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	OCC1	Q8TAD7	63 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	LMX1A	Q8TE12	382 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	PIGC	Q92535	297 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	LOXL4	Q96JB6	756 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	VPS25	Q9BRG1	176 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	CSTL1	Q9H114	145 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	C1RL	Q9NZP8	487 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	CLN8	Q9UBY8	286 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032		V9GYV3	84 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	PI4KA	P42356	2102 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	SDK2	Q58EX2	2172 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	BRCA2	P51587	3418 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	C9orf118	A6NHY6	69 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	CBY3	A6NI87	242 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	LRRC30	A6NM36	301 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	C15orf62	A8K5M9	175 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	TMEM238	C9JI98	176 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032		H0YJW9	148 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032		K7EN84	100 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	NDUFS8	O00217	210 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	BMPR1B	O00238	502 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	CDIPT	O14735	213 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	TAX1BP3	O14907	124 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	RAB29	O14966	203 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	MPDU1	O75352	247 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	CXorf1	O96002	111 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	HLA-DRB1	P01911	266 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	IGHV4-34	P06331	123 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	STAG3L2	P0CL84	134 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	STAG3L3	P0CL85	134 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	AREG	P15514	252 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	ZNF32	P17041	273 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	COL8A1	P27658	744 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	ARR3	P36575	388 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	OPRK1	P41145	380 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	GABRA2	P47869	451 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	THBS3	P49746	956 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	CLDN18	P56856	261 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	SELENOV	P59797	346 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	CX3CL1	P78423	397 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	FHL3	Q13643	280 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	VAMP3	Q15836	100 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	MMD2	Q8IY49	270 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	MKX	Q8IYA7	352 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	OR1L1	Q8NH94	360 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	TSKU	Q8WUA8	353 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	DEFB118	Q96PH6	123 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	RCHY1	Q96PM5	261 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	OR8B2	Q96RD0	313 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	ST20	Q9HBF5	79 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	OSTC	Q9NRP0	149 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	WNT16	Q9UBV4	365 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BBX-222	ENST00000472032	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		3.36	□□□□□ -1.87

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