RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467080.1

RBM17-208, Transcript of RNA binding motif protein 17, human

TSL 2

Gene RBM17, Length 837 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM17-208	ENST00000467080	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	LEAP2	Q969E1	77 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF714	Q96N38	554 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	CHST6	Q9GZX3	395 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	OR51M1	Q9H341	326 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	DHRS12	A0PJE2	317 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	TMEM210	A6NLX4	147 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	C12orf77	C9JDV5	145 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	RTL8C	O15255	209 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	MYCBP2	O75592	4640 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	CST4	P01036	141 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	GYPB	P06028	91 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	SLC2A5	P22732	501 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	PSMB8	P28062	276 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	CRABP1	P29762	137 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	BRS3	P32247	399 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	OMP	P47874	163 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	SLC35B1	P78383	322 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF45	Q02386	682 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	TRAM2	Q15035	370 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	ATP6AP1	Q15904	470 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	EPGN	Q6UW88	154 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF429	Q86V71	674 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	CALHM1	Q8IU99	346 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF561	Q8N587	486 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	SLC29A1	Q99808	456 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	TMED9	Q9BVK6	235 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF878	C9JN71	531 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080		G3V318	75 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	FXYD1	O00168	92 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	AGPAT2	O15120	278 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	IGKV1D-33	P01593	117 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	IGKV1-33	P01594	117 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	RBP4	P02753	201 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	IFNA6	P05013	189 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	CDK2	P24941	298 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	NPBWR2	P48146	333 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	INSL3	P51460	131 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF616	Q08AN1	781 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	HES1	Q14469	280 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080		Q8N9W7	124 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	FANK1	Q8TC84	345 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	GPX8	Q8TED1	209 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	KCTD7	Q96MP8	289 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	OR52D1	Q9H346	318 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	HES4	Q9HCC6	221 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080		A6NIN4	97 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	FAM25E	A8MYX2	175 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	LEUTX	A8MZ59	168 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080		M0QZK8	103 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	FGF16	O43320	207 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	IGLV1-51	P01701	117 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	DCK	P27707	260 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	KDELR2	P33947	212 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	HAAO	P46952	286 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	REG1B	P48304	166 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	GNG3	P63215	75 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	TNFRSF9	Q07011	255 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RBM17-208	ENST00000467080	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		3.55	□□□□□ -1.84

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