RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466359.1

NFX1-205, Transcript of nuclear transcription factor, X-box binding 1, human

TSL 3

Gene NFX1, Length 391 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFX1-205	ENST00000466359	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	RUNX1	Q01196	453 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	FXYD3	Q14802	87 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	NMS	Q5H8A3	153 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359		Q6ZS46	218 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	ARPC1A	Q92747	370 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	MDFI	Q99750	246 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	MSGN1	A6NI15	193 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	C15orf61	A6NNL5	157 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	TEX22	C9J3V5	150 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	PITX3	O75364	302 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	SNAPC5	O75971	98 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	DHFR	P00374	187 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	CA2	P00918	260 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	IGKV1-5	P01602	117 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	OPN1MW	P04001	364 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	AKR1C4	P17516	323 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	RAB25	P57735	213 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	SPCS3	P61009	180 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	NDP	Q00604	133 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	DHRS2	Q13268	280 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	PPP1R1A	Q13522	171 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	PLGLA	Q15195	96 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	TRIM16L	Q309B1	348 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	PLET1	Q6UQ28	207 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	LYG2	Q86SG7	212 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF695	Q8IW36	515 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	COQ8A	Q8NI60	647 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	USMG5	Q96IX5	58 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	GPHA2	Q96T91	129 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	NUDT15	Q9NV35	164 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359		A0A0G2JLM5	398 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359		A0A1B0GW64	132 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359		A0A1W2PN81	502 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	PSMB11	A5LHX3	300 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	ATP6V0E1	O15342	81 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	CYB5B	O43169	146 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	CNIH1	O95406	144 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	CTRB1	P17538	263 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	PSMB6	P28072	239 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	G6PC	P35575	357 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	CHRNA7	P36544	502 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	RAB9A	P51151	201 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	PRCD	Q00LT1	54 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	OXA1L	Q15070	435 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	BSX	Q3C1V8	233 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	SP6	Q3SY56	376 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFX1-205	ENST00000466359		Q6ZRM9	215 aa		4.63	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms