RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 YPEL4Q96NS1 127 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 NABP2Q9BQ15 211 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 PCGF1Q9BSM1 259 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 GGACTQ9BVM4 153 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 COQ3Q9NZJ6 369 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 EPG5Q9HCE0 2579 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 LRRK2Q5S007 2527 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 PLXNB1O43157 2135 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 SCO2A0A1W2PP80 73 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 C22orf46C9J442 243 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 F8W036 122 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 LYNX1G3V0Z9 82 aa4.57□□□□□ -1.68
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PTPRC-210ENST00000462363 AGPAT2O15120 278 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 YIF1AO95070 293 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 HRASP01112 189 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 HBE1P02100 147 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 CRYGBP07316 175 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 SOD3P08294 240 aa4.57□□□□□ -1.68
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PTPRC-210ENST00000462363 LYNX1P0DP58 116 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 MYOD1P15172 320 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 NFYBP25208 207 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 GNG10P50151 68 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 RAB2AP61019 212 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 PRCDQ00LT1 54 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 PAX2Q02962 417 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 HAGHQ16775 308 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 HFEQ30201 348 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM41BQ5BJD5 291 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 SPINK9Q5DT21 86 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 OR8G2PQ6IF36 304 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 HCP5Q6MZN7 132 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 PDPNQ86YL7 162 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 CLRN3Q8NCR9 226 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 OR13D1Q8NGV5 346 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 OR9G1Q8NH87 305 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 AIFM2Q9BRQ8 373 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 NPCDR1Q9BY65 106 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 SLC35B3Q9H1N7 401 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM133Q9H2Q1 129 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 TREM1Q9NP99 234 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 SLC35D1Q9NTN3 355 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 CBLN4Q9NTU7 201 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 FBXO7Q9Y3I1 522 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 KPTNQ9Y664 436 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
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PTPRC-210ENST00000462363 CEBPZOSA8MTT3 80 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 C19orf84I3L1E1 186 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 SOX15O60248 233 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 MPDU1O75352 247 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 KBTBD11O94819 623 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 PRH1P02810 166 aa4.56□□□□□ -1.68
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PTPRC-210ENST00000462363 UQCRFS1P47985 274 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 ERVK-16P61578 105 aa4.56□□□□□ -1.68
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PTPRC-210ENST00000462363 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
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PTPRC-210ENST00000462363 HLA-DRB5Q30154 266 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 C2orf83Q53S99 150 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 KHDC3LQ587J8 217 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa4.56□□□□□ -1.68
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PTPRC-210ENST00000462363 FAM90A2PQ658T7 463 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 SSX9Q7RTT3 188 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 ABHD12Q8N2K0 398 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 LILRB2Q8N423 598 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 BEND2Q8NDZ0 799 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 OR10P1Q8NGE3 313 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 OR4P4Q8NGL7 312 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 OR5B3Q8NH48 314 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 OR4A16Q8NH70 328 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 OR4A5Q8NH83 315 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 RAB1CQ92928 201 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM186Q96B77 213 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-210ENST00000462363 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
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