RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 hADV38S2A0JD32 116 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM159BA6NKW6 160 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM238C9JI98 176 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 SRP19P09132 144 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 CD200P41217 278 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 XCL1P47992 114 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 SERPINB9P50453 376 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 GRK1Q15835 563 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 SSX8Q7RTT4 187 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 ANKRD29Q8N6D5 301 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 OR52L1Q8NGH7 329 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 OR13C8Q8NGS7 320 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 SMCR5Q8TEV8 140 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 C14orf105Q9NVL8 296 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa2.62□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 OR2B3O76000 313 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 GZMBP10144 247 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 CPMP14384 443 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 MAGEA12P43365 314 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 GNG10P50151 68 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 TAS2R20P59543 309 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 VBP1P61758 197 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 RPL30P62888 115 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 SMARCD3Q6STE5 483 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 OR51A2Q8NGJ7 313 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 AP3S1Q92572 193 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 BTF3L4Q96K17 158 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM147Q9BVK8 224 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 AICDAQ9GZX7 198 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 ARMC1Q9NVT9 282 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 KIF13BQ9NQT8 1826 aa2.61□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa2.6□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa2.6□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 G3V3Q6 166 aa2.6□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 H3BPC8 53 aa2.6□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 I3L521 148 aa2.6□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 NPYP01303 97 aa2.6□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 SERPINA7P05543 415 aa2.6□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 CD24P25063 80 aa2.6□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 RAB13P51153 203 aa2.6□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 DEFA1P59665 94 aa2.6□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 TEX36Q5VZQ5 186 aa2.6□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 TMPPEQ6ZT21 453 aa2.6□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 OOSP2Q86WS3 158 aa2.6□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 OR5C1Q8NGR4 320 aa2.6□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF675Q8TD23 568 aa2.6□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 CEP19Q96LK0 163 aa2.6□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 MIEN1Q9BRT3 115 aa2.6□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 KIFC1Q9BW19 673 aa2.6□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa2.6□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa2.59□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM235A6NFC5 223 aa2.59□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 E5RI56 91 aa2.59□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 PDE6DO43924 150 aa2.59□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF728P0DKX0 622 aa2.59□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 CCL5P13501 91 aa2.59□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 G0S2P27469 103 aa2.59□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 C9orf64Q5T6V5 341 aa2.59□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 LYG2Q86SG7 212 aa2.59□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 TBC1D19Q8N5T2 526 aa2.59□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 PHB2Q99623 299 aa2.59□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 PRRT1Q99946 306 aa2.59□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa2.59□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 EFCAB1Q9HAE3 211 aa2.59□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 FBXL12Q9NXK8 326 aa2.59□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
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RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa2.59□□□□□ -1.99
RABGGTB-205ENST00000462042 GREB1Q4ZG55 1949 aa2.59□□□□□ -1.99
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RABGGTB-205ENST00000462042 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa2.58□□□□□ -2
RABGGTB-205ENST00000462042 CTSGP08311 255 aa2.58□□□□□ -2
RABGGTB-205ENST00000462042 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RABGGTB-205ENST00000462042 FXYD7P58549 80 aa2.58□□□□□ -2
RABGGTB-205ENST00000462042 B2MP61769 119 aa2.58□□□□□ -2
RABGGTB-205ENST00000462042 TNFRSF9Q07011 255 aa2.58□□□□□ -2
RABGGTB-205ENST00000462042 GDPD1Q8N9F7 314 aa2.58□□□□□ -2
RABGGTB-205ENST00000462042 CT55Q8WUE5 264 aa2.58□□□□□ -2
RABGGTB-205ENST00000462042 FGF13Q92913 245 aa2.58□□□□□ -2
RABGGTB-205ENST00000462042 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RABGGTB-205ENST00000462042 XAGE1AQ9HD64 81 aa2.58□□□□□ -2
RABGGTB-205ENST00000462042 UQCC1Q9NVA1 299 aa2.58□□□□□ -2
RABGGTB-205ENST00000462042 TP73-AS1Q9UF72 201 aa2.58□□□□□ -2
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
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