RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	TREML4	Q6UXN2	200 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	PNKD	Q8N490	385 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF383	Q8NA42	475 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	UHRF2	Q96PU4	802 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	VSIR	Q9H7M9	311 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC25A22	Q9H936	323 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	PLCE1	Q9P212	2302 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF292	O60281	2723 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	PRSS46	E5RG02	174 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	UBE2C	O00762	179 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC31A2	O15432	143 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	SMIM6	P0DI80	62 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	GNG10	P50151	68 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	PPOX	P50336	477 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	AKR1D1	P51857	326 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	S100A12	P80511	92 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	TFF3	Q07654	80 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	BSX	Q3C1V8	233 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	TCF23	Q7RTU1	214 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	OR4F5	Q8NH21	305 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	CCL17	Q92583	94 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	NEUROG1	Q92886	237 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	HARBI1	Q96MB7	349 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	OR4F4	Q96R69	305 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	RFNG	Q9Y644	331 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	SHISA9	B4DS77	424 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	C11orf94	C9JXX5	98 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	AP4M1	O00189	453 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	CORT	O00230	105 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	DLL1	O00548	723 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	FBP1	P09467	338 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	STAG3L2	P0CL84	134 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	STAG3L3	P0CL85	134 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	CT45A6	P0DMU7	189 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	CT45A5	P0DMU8	189 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	CT45A7	P0DMV0	189 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	B2M	P61769	119 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	ELOB	Q15370	118 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	SPRN	Q5BIV9	151 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM201A	Q5SY85	155 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	IMMP2L	Q96T52	175 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	DOK5	Q9P104	306 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	C5orf52	A6NGY3	159 aa		9.42	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	RRH	O14718	337 aa		9.42	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	AKR1C3	P42330	323 aa		9.42	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	CD81	P60033	236 aa		9.42	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		9.42	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		9.42	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	9.42	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		9.42	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		9.42	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	ISOC2	Q96AB3	205 aa		9.42	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	TIMD4	Q96H15	378 aa		9.42	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	YPEL4	Q96NS1	127 aa		9.42	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	PFDN5	Q99471	154 aa		9.42	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	RNF5	Q99942	180 aa		9.42	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		9.42	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	MIOX	Q9UGB7	285 aa		9.42	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		9.42	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		9.41	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758		E7EQL1	145 aa		9.41	□□□□□ -0.9
TTLL3-222	ENST00000459758		H0YJW9	148 aa		9.41	□□□□□ -0.9

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