RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 FAM159AQ6UWV7 190 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 HIST1H4GQ99525 98 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 DOCK3Q8IZD9 2030 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 FADS6Q8N9I5 356 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 MOB4Q9Y3A3 225 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRF-209ENST00000438120 STAG3L2P0CL84 134 aa14.52□□□□□ -0.08
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PTPRF-209ENST00000438120 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRF-209ENST00000438120 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
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PTPRF-209ENST00000438120 NPIPB4C9JG80 1138 aa14.51□□□□□ -0.09
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PTPRF-209ENST00000438120 C2orf68Q2NKX9 166 aa14.51□□□□□ -0.09
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PTPRF-209ENST00000438120 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRF-209ENST00000438120 DPM3Q9P2X0 92 aa14.51□□□□□ -0.09
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PTPRF-209ENST00000438120 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRF-209ENST00000438120 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
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PTPRF-209ENST00000438120 MSGN1A6NI15 193 aa14.5□□□□□ -0.09
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PTPRF-209ENST00000438120 CD69Q07108 199 aa14.49□□□□□ -0.09
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PTPRF-209ENST00000438120 EMP1P54849 157 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRF-209ENST00000438120 TUBA4BQ9H853 241 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRF-209ENST00000438120 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PTPRF-209ENST00000438120 PARP14Q460N5 1801 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRF-209ENST00000438120 TRGC1P0CF51 173 aa14.47□□□□□ -0.09
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