RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431283.1

PTPN4-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, human

TSL 3

Gene PTPN4, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN4-204	ENST00000431283	HMG20A	Q9NP66	347 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	CLN6	Q9NWW5	311 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	COPS3	Q9UNS2	423 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		2.57	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	LYST	Q99698	3801 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283		A0A0J9YXY3	114 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283		A0A1B0GTI1	187 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	METTL15	A6NJ78	407 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283		H3BSH0	61 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	OVOL1	O14753	267 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	HSD17B6	O14756	317 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	MAGEB3	O15480	346 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	SULT1C4	O75897	302 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	MOS	P00540	346 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	IFNA6	P05013	189 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	CSN2	P05814	226 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	CALCB	P10092	127 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	GZMH	P20718	246 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	CCL1	P22362	96 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	SLC2A5	P22732	501 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	SOX6	P35712	828 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	NPBWR2	P48146	333 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	KCNJ3	P48549	501 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF616	Q08AN1	781 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	LTC4S	Q16873	150 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	DEFB136	Q30KP8	78 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283		Q6ZSR3	168 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	GID4	Q8IVV7	300 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283		Q8N9W7	124 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	OPALIN	Q96PE5	141 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	OR4C12	Q96R67	309 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	MBOAT4	Q96T53	435 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	ABCG5	Q9H222	651 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	CALY	Q9NYX4	217 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	CCDC182	A6NF36	153 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	DCTN3	O75935	186 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	IGKV1-17	P01599	117 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	IGHV3-7	P01780	117 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	IGHG4	P01861	327 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	IGF1	P05019	195 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	OR8U9	P0C7N5	309 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	SPN	P16150	400 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	ATF1	P18846	271 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	CD40LG	P29965	261 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	KIR3DL2	P43630	455 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	REG1B	P48304	166 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	GNG10	P50151	68 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	CRISP1	P54107	249 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	RUNX1	Q01196	453 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	RSU1	Q15404	277 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	FAHD1	Q6P587	224 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	UTS2B	Q765I0	119 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	RDH10	Q8IZV5	341 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	LEAP2	Q969E1	77 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	ASB9	Q96DX5	294 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	NRBF2	Q96F24	287 aa		2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
PTPN4-204	ENST00000431283	KCTD7	Q96MP8	289 aa		2.55	□□□□□ -2

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