RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR51B2Q9Y5P1 312 aa8.18□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRIM77I1YAP6 450 aa8.17□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GPR137BO60478 399 aa8.17□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MED6O75586 246 aa8.17□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SCGB1D2O95969 90 aa8.17□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CA2P00918 260 aa8.17□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR9G9P0C7N8 305 aa8.17□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PET100P0DJ07 73 aa8.17□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FCN2Q15485 313 aa8.17□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 Q8N9W7 124 aa8.17□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR1L8Q8NGR8 309 aa8.17□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GPR146Q96CH1 333 aa8.17□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RITA1Q96K30 269 aa8.17□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C2orf50Q96LR7 162 aa8.17□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRSS22Q9GZN4 317 aa8.17□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.17□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa8.17□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NSG2Q9Y328 171 aa8.17□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A0G2JRQ6 117 aa8.16□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A1W2PN81 502 aa8.16□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HMX3A6NHT5 357 aa8.16□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CEBPZOSA8MTT3 80 aa8.16□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM90A26D6RGX4 464 aa8.16□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CHST1O43916 411 aa8.16□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 P0C879 139 aa8.16□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRAPPC2P0DI81 140 aa8.16□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRAPPC2BP0DI82 140 aa8.16□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CHRNA7P36544 502 aa8.16□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 S100A10P60903 97 aa8.16□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 UBA52P62987 128 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RELBQ01201 579 aa8.16□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FXYD3Q14802 87 aa8.16□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa8.16□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC35E3Q7Z769 313 aa8.16□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF429Q86V71 674 aa8.16□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GRPEL2Q8TAA5 225 aa8.16□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ARPC1AQ92747 370 aa8.16□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HINT2Q9BX68 163 aa8.16□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NMES1Q9C002 83 aa8.16□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PLEKHA3Q9HB20 300 aa8.16□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PLSCR3Q9NRY6 295 aa8.16□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM14BQ9NUH8 114 aa8.16□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ST8SIA3O43173 380 aa8.15□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NXPH3O95157 252 aa8.15□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SIX6O95475 246 aa8.15□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LY86O95711 162 aa8.15□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RLN2P04090 185 aa8.15□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CRYGBP07316 175 aa8.15□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GIPP09681 153 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 COMPP49747 757 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BCAP31P51572 246 aa8.15□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPCS3P61009 180 aa8.15□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FBLN7Q53RD9 439 aa8.15□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF562Q6V9R5 426 aa8.15□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR52E5Q8NH55 327 aa8.15□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR10C1Q96KK4 312 aa8.15□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HIPK2Q9H2X6 1198 aa8.15□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PARP11Q9NR21 331 aa8.15□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.15□□□□□ -1.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRAV3A0A0B4J244 114 aa8.14□□□□□ -1.11
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MPTX1A8MV57 137 aa8.14□□□□□ -1.11
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 L7N2F9 121 aa8.14□□□□□ -1.11
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AP4M1O00189 453 aa8.14□□□□□ -1.11
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CYB5BO43169 146 aa8.14□□□□□ -1.11
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OPN1MWP04001 364 aa8.14□□□□□ -1.11
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OPN1MW2P0DN77 364 aa8.14□□□□□ -1.11
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OPN1MW3P0DN78 364 aa8.14□□□□□ -1.11
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RAP2BP61225 183 aa8.14□□□□□ -1.11
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 VAMP2P63027 116 aa8.14□□□□□ -1.11
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RPP30P78346 268 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CX3CL1P78423 397 aa8.14□□□□□ -1.11
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CD83Q01151 205 aa8.14□□□□□ -1.11
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TNFRSF9Q07011 255 aa8.14□□□□□ -1.11
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FGL1Q08830 312 aa8.14□□□□□ -1.11
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PJVKQ0ZLH3 352 aa8.14□□□□□ -1.11
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AKAP14Q86UN6 197 aa8.14□□□□□ -1.11
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR11H7Q8NGC8 314 aa8.14□□□□□ -1.11
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR2T6Q8NHC8 308 aa8.14□□□□□ -1.11
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GON7Q9BXV9 100 aa8.14□□□□□ -1.11
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ESM1Q9NQ30 184 aa8.14□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms