RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM74A7A6NL05 159 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 H0YJW9 148 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 PPIAL4GP0DN37 164 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 OR13C7P0DN81 318 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 CDKN1AP38936 164 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 CEBPGP53567 150 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 DLX6P56179 175 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 RAB2AP61019 212 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 GNB2P62879 340 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 RPP30P78346 268 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 SERF2P84101 59 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 AARDQ4LEZ3 155 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM74A3Q4VXF1 159 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF429Q86V71 674 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 C11orf42Q8N5U0 333 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF709Q8N972 641 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 LFNGQ8NES3 379 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 OR8B3Q8NGG8 313 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 OR52E5Q8NH55 327 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 OR9G1Q8NH87 305 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 RAB1CQ92928 201 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 LHX4Q969G2 390 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 TIMD4Q96H15 378 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 HARBI1Q96MB7 349 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 OR8B2Q96RD0 313 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 SCRT1Q9BWW7 348 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM133Q9H2Q1 129 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 OR51B2Q9Y5P1 312 aa3.24□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 RBFOX3A6NFN3 312 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 C19orf84I3L1E1 186 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 UPK2O00526 184 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ENSAO43768 121 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 NDUFS7O75251 213 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 KBTBD11O94819 623 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 SNAPINO95295 136 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 COX7A1P24310 79 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 CD1BP29016 333 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 NPBWR1P48145 328 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 RAB11AP62491 216 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 POU2AF1Q16633 256 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 C10orf91Q5T1B1 145 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 C11orf71Q6IPW1 123 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM88Q6PEY1 159 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 Q8N1Y9 231 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM186Q96B77 213 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 NABP2Q9BQ15 211 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 UBTD1Q9HAC8 227 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM14BQ9NUH8 114 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 TACC2O95359 2948 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 BTBD17A6NE02 478 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM157AC9JC47 383 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 HBE1P02100 147 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ARG1P05089 322 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 PF4V1P10720 104 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF726P1Q15940 193 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 FFAR4Q5NUL3 377 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ACSM6Q6P461 480 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 DPPA3Q6W0C5 159 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00311Q8N616 119 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 OR5AN1Q8NGI8 311 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 SVIPQ8NHG7 77 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 RXFP4Q8TDU9 374 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM170AQ8WVE7 144 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 AIFM2Q9BRQ8 373 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC39A9Q9NUM3 307 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 KIAA1456Q9P272 454 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 GNG13Q9P2W3 67 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ONECUT1Q9UBC0 465 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 MIOXQ9UGB7 285 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 PRNDQ9UKY0 176 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A1W2PPH5 198 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM8BA6NDV4 472 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 ZFP92A6NM28 416 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 LY86O95711 162 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 CA2P00918 260 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 IGKV1D-33P01593 117 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 IGKV1-33P01594 117 aa3.23□□□□□ -1.89
LRRTM4-201ENST00000409088 FBP1P09467 338 aa3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms