RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM177Q53S58 311 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-202ENST00000400053 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-202ENST00000400053 KIR3DL3Q8N743 410 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00470Q9BZP3 86 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-202ENST00000400053 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-202ENST00000400053 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa7.59□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 A1L4Q6 167 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 EPOPA6NHQ4 379 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 AHRRA9YTQ3 701 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 NPPCP23582 126 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 CEACAM21Q3KPI0 293 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 C2orf88Q9BSF0 95 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 POLEQ07864 2286 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 ZG16O60844 167 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 NUBP1P53384 320 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 COL10A1Q03692 680 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 SNAI3Q3KNW1 292 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 WNT5BQ9H1J7 359 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 SLC25A20O43772 301 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 ARL14EPLP0DKL9 152 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 ATP5G2Q06055 141 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF56Q15929 161 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF506Q5JVG8 444 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 GATAD1Q8WUU5 269 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 PKIBQ9C010 78 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 B4E171 279 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 LDLRAD4O15165 306 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 SRP19P09132 144 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 OR4D5Q8NGN0 318 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 RND2P52198 227 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 Q96M66 194 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 DUX5Q96PT3 197 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 IMMP2LQ96T52 175 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 C19orf67A6NJJ6 358 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 DCAF10Q5QP82 559 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 C1QL2Q7Z5L3 287 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 BIVMQ86UB2 503 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 VWCEQ96DN2 955 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 WNK2Q9Y3S1 2297 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV3-11P04433 115 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 UCP3P55916 312 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 TNFRSF9Q07011 255 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF645Q8N7E2 425 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM186Q96B77 213 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 NEU1Q99519 415 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 PIMREGQ9BSJ6 248 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1B0GW15 77 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 DPRXA6NFQ7 191 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 EGR4Q05215 589 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF826PQ6ZT77 177 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 SMIM8Q96KF7 97 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM74BQ9NUR3 256 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 OR2H2O95918 312 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV3-15P01624 115 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 FAM214BQ7L5A3 538 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 OR9G1Q8NH87 305 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 SMOC1Q9H4F8 434 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 DOCK6Q96HP0 2047 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 CEACAM4O75871 244 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 CELA2AP08217 269 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 SLC25A45Q8N413 288 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 OR8G5Q8NG78 346 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 CREBBPQ92793 2442 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 PRR33A8MZF0 331 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 ABHD12Q8N2K0 398 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 DLL3Q9NYJ7 618 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 JPT1Q9UK76 154 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 MED12Q93074 2177 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 A0A087WV48 116 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1W2PR77 199 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM262E9PQX1 116 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 H3BTX0 84 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 FOXH1O75593 365 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 PF4P02776 101 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 UCP2P55851 309 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 LY6G6FQ5SQ64 297 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 SAXO1Q8IYX7 474 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF414Q96IQ9 312 aa7.56□□□□□ -1.2
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