RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM68Q96MH6 324 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 MS4A10Q96PG2 267 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 SLA2Q9H6Q3 261 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 SLC2A8Q9NY64 477 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 PTTG2Q9NZH5 202 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 COMMD9Q9P000 198 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 COPZ2Q9P299 210 aa5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 V9GYH0 126 aa5.93□□□□□ -1.46
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SGMS1-201ENST00000361543 A0A087WW49 117 aa5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 NAP1L6A6NFF2 107 aa5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 LINC01619G3V211 115 aa5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 H3BUA1 57 aa5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 M0QYG6 137 aa5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 OVOL1O14753 267 aa5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 RAMP3O60896 148 aa5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 HPRT1P00492 218 aa5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 IGLV2-14P01704 120 aa5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV3-11P01762 117 aa5.92□□□□□ -1.46
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SGMS1-201ENST00000361543 SERPINE2P07093 398 aa5.92□□□□□ -1.46
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SGMS1-201ENST00000361543 F2RP25116 425 aa5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 GNRHRP30968 328 aa5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 MAS1LP35410 378 aa5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 SLURP1P55000 103 aa5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 RND3P61587 244 aa5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa5.92□□□□□ -1.46
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SGMS1-201ENST00000361543 IDO2Q6ZQW0 420 aa5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa5.92□□□□□ -1.46
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SGMS1-201ENST00000361543 MMD2Q8IY49 270 aa5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 SPAG16Q8N0X2 631 aa5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 CADM3Q8N126 398 aa5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 OR4A5Q8NH83 315 aa5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 DCUN1D4Q92564 292 aa5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 PRR25Q96S07 402 aa5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 TSC22D3Q99576 134 aa5.92□□□□□ -1.46
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SGMS1-201ENST00000361543 CCL28Q9NRJ3 127 aa5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 MCUBQ9NWR8 336 aa5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 SORL1Q92673 2214 aa5.91□□□□□ -1.46
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SGMS1-201ENST00000361543 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa5.91□□□□□ -1.46
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SGMS1-201ENST00000361543 RPL30P62888 115 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 CD69Q07108 199 aa5.91□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
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SGMS1-201ENST00000361543 PRSS8Q16651 343 aa5.91□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa5.91□□□□□ -1.46
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SGMS1-201ENST00000361543 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF429Q86V71 674 aa5.91□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 OR5T1Q8NG75 326 aa5.91□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 OR4C16Q8NGL9 310 aa5.91□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 OR51H1Q8NH63 302 aa5.91□□□□□ -1.46
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SGMS1-201ENST00000361543 PHB2Q99623 299 aa5.91□□□□□ -1.46
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SGMS1-201ENST00000361543 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa5.91□□□□□ -1.46
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SGMS1-201ENST00000361543 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
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SGMS1-201ENST00000361543 COA4Q9NYJ1 87 aa5.91□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 CACFD1Q9UGQ2 172 aa5.91□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 A0A0G2JLM5 398 aa5.9□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 H0Y980 276 aa5.9□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 MPPED1O15442 326 aa5.9□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 CYB5BO43169 146 aa5.9□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 LY86O95711 162 aa5.9□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 PPP5CP53041 499 aa5.9□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 PIGPP57054 158 aa5.9□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 SRPXP78539 464 aa5.9□□□□□ -1.46
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