RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 DPM2O94777 84 aa4.2□□□□□ -1.74
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PTPRD-201ENST00000355233 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 LYPD8Q6UX82 237 aa4.2□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM144Q7Z5S9 345 aa4.2□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 GLRX5Q86SX6 157 aa4.2□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
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PTPRD-201ENST00000355233 A6NIN4 97 aa4.2□□□□□ -1.74
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PTPRD-201ENST00000355233 SCGB3A1Q96QR1 104 aa4.2□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa4.2□□□□□ -1.74
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PTPRD-201ENST00000355233 IGLV3-19P01714 112 aa4.2□□□□□ -1.74
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PTPRD-201ENST00000355233 FHL5Q5TD97 284 aa4.2□□□□□ -1.74
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PTPRD-201ENST00000355233 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
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PTPRD-201ENST00000355233 TSKUQ8WUA8 353 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 C12orf49Q9H741 205 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 EML6Q6ZMW3 1958 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 A8MWV9 139 aa4.19□□□□□ -1.74
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PTPRD-201ENST00000355233 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 B4GALT1P15291 398 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 CTAG1AP78358 180 aa4.19□□□□□ -1.74
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PTPRD-201ENST00000355233 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
PTPRD-201ENST00000355233 SLC25A16P16260 332 aa4.19□□□□□ -1.74
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