RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325103.10

HPS1-201, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPS1, Length 3,703 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-201ENST00000325103 MED9Q9NWA0 146 aa10.64□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa10.63□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 SLC35B3Q9H1N7 401 aa10.63□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 ZNF462Q96JM2 2506 aa10.63□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 POLQO75417 2590 aa10.63□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 KBTBD11O94819 623 aa10.63□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 CA2P00918 260 aa10.63□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 WNT2P09544 360 aa10.63□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 CT45A6P0DMU7 189 aa10.63□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 CT45A5P0DMU8 189 aa10.63□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 CT45A7P0DMV0 189 aa10.63□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 GCSAMLQ5JQS6 135 aa10.63□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 PRNDQ9UKY0 176 aa10.63□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 AUP1Q9Y679 476 aa10.63□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 NOTCH2Q04721 2471 aa10.63□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 LOXP28300 417 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 PSMB3P49720 205 aa10.63□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 KLRD1Q13241 179 aa10.63□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 ADIRFQ15847 76 aa10.63□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 TEX36Q5VZQ5 186 aa10.63□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
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HPS1-201ENST00000325103 C9JQL5 133 aa10.62□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 BRWD1-AS2P59051 145 aa10.62□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 RPL8P62917 257 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 MMDQ15546 238 aa10.62□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa10.62□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 SSUH2Q9Y2M2 353 aa10.62□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 SIAH2O43255 324 aa10.62□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 S100A6P06703 90 aa10.62□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 OR5G3P0C626 314 aa10.62□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 SLC35E1Q96K37 410 aa10.62□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 LOC105371242A0A075B767 164 aa10.62□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 OR7C2O60412 319 aa10.62□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 IGHV1-8P0DP01 117 aa10.62□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 AWAT1Q58HT5 328 aa10.62□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 HAPLN4Q86UW8 402 aa10.62□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 C2CD4CQ8TF44 421 aa10.62□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 WASHC3Q9Y3C0 194 aa10.62□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 ZNF727A8MUV8 499 aa10.61□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 ATP6V1FQ16864 119 aa10.61□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa10.61□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 FAM222BQ8WU58 562 aa10.61□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 CLEC7AQ9BXN2 247 aa10.61□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 TMEM133Q9H2Q1 129 aa10.61□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa10.61□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 CCDC168Q8NDH2 2452 aa10.61□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 LIPFP07098 398 aa10.61□□□□□ -0.71
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HPS1-201ENST00000325103 TMEM41BQ5BJD5 291 aa10.61□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 ZNF429Q86V71 674 aa10.61□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 OR4C13Q8NGP0 309 aa10.61□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 MIOXQ9UGB7 285 aa10.61□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 HCFC1P51610 2035 aa10.61□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 RAB13P51153 203 aa10.61□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 B2MP61769 119 aa10.61□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 TCF23Q7RTU1 214 aa10.61□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 NECAP1Q8NC96 275 aa10.61□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 CLRN3Q8NCR9 226 aa10.61□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 OR1L8Q8NGR8 309 aa10.61□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 FAM216AQ8WUB2 273 aa10.61□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 RPH3ALQ9UNE2 315 aa10.61□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 PPOXP50336 477 aa10.6□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 RELBQ01201 579 aa10.6□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 RAB24Q969Q5 203 aa10.6□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 TMEM186Q96B77 213 aa10.6□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 SEC11CQ9BY50 192 aa10.6□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 FBXL15Q9H469 300 aa10.6□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 PAGE4O60829 102 aa10.6□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 KIAA1456Q9P272 454 aa10.6□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 ADCYAP1P18509 176 aa10.6□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 SMIM7Q9BQ49 75 aa10.6□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 NPCDR1Q9BY65 106 aa10.6□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 COA4Q9NYJ1 87 aa10.6□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 PXMP4Q9Y6I8 212 aa10.6□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 C15orf61A6NNL5 157 aa10.59□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 C9orf152Q5JTZ5 239 aa10.59□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 FAM78BQ5VT40 261 aa10.59□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 C22orf15Q8WYQ4 148 aa10.59□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 FKBP11Q9NYL4 201 aa10.59□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP10.59□□□□□ -0.713e-6■■■□□ 16.6
HPS1-201ENST00000325103 VSTM2AQ8TAG5 236 aa10.59□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa10.59□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 C7orf77A4D0Y5 90 aa10.59□□□□□ -0.71
HPS1-201ENST00000325103 MBP02144 154 aa10.59□□□□□ -0.71
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