RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
TSNARE1-201ENST00000307180 RPRMQ9NS64 109 aa12.98□□□□□ -0.33
TSNARE1-201ENST00000307180 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa12.97□□□□□ -0.33
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A1W2PPE3 182 aa12.97□□□□□ -0.33
TSNARE1-201ENST00000307180 MARCH11A6NNE9 402 aa12.97□□□□□ -0.33
TSNARE1-201ENST00000307180 M0R1X1 148 aa12.97□□□□□ -0.33
TSNARE1-201ENST00000307180 FCGR3BO75015 233 aa12.97□□□□□ -0.33
TSNARE1-201ENST00000307180 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
TSNARE1-201ENST00000307180 IGHV3-7P01780 117 aa12.97□□□□□ -0.33
TSNARE1-201ENST00000307180 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
TSNARE1-201ENST00000307180 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
TSNARE1-201ENST00000307180 SERF2P84101 59 aa12.97□□□□□ -0.33
TSNARE1-201ENST00000307180 HAGHQ16775 308 aa12.97□□□□□ -0.33
TSNARE1-201ENST00000307180 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
TSNARE1-201ENST00000307180 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
TSNARE1-201ENST00000307180 RAB9BQ9NP90 201 aa12.97□□□□□ -0.33
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM106BQ9NUM4 274 aa12.97□□□□□ -0.33
TSNARE1-201ENST00000307180 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa12.96□□□□□ -0.33
TSNARE1-201ENST00000307180 NDUFS8O00217 210 aa12.96□□□□□ -0.33
TSNARE1-201ENST00000307180 HPRT1P00492 218 aa12.96□□□□□ -0.33
TSNARE1-201ENST00000307180 IRF2P14316 349 aa12.96□□□□□ -0.33
TSNARE1-201ENST00000307180 ATP6V1FQ16864 119 aa12.96□□□□□ -0.33
TSNARE1-201ENST00000307180 RPL39P5Q59GN2 51 aa12.96□□□□□ -0.33
TSNARE1-201ENST00000307180 SOHLH1Q5JUK2 328 aa12.96□□□□□ -0.33
TSNARE1-201ENST00000307180 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
TSNARE1-201ENST00000307180 ETV3LQ6ZN32 361 aa12.96□□□□□ -0.33
TSNARE1-201ENST00000307180 C1QL4Q86Z23 238 aa12.96□□□□□ -0.33
TSNARE1-201ENST00000307180 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP12.96□□□□□ -0.33
TSNARE1-201ENST00000307180 GAFA1Q96PS6 74 aa12.96□□□□□ -0.33
TSNARE1-201ENST00000307180 CCL13Q99616 98 aa12.96□□□□□ -0.33
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF665Q9H7R5 613 aa12.96□□□□□ -0.33
TSNARE1-201ENST00000307180 RPS10P5Q9NQ39 176 aa12.96□□□□□ -0.33
TSNARE1-201ENST00000307180 CBY1Q9Y3M2 126 aa12.96□□□□□ -0.33
TSNARE1-201ENST00000307180 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa12.96□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 C7orf77A4D0Y5 90 aa12.96□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 CEBPZOSA8MTT3 80 aa12.96□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 ITGB1BP1O14713 200 aa12.96□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 GYPAP02724 150 aa12.96□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 ZDHHC16Q969W1 377 aa12.96□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 SSX3Q99909 188 aa12.96□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 IFI27L2Q9H2X8 130 aa12.96□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 VSIRQ9H7M9 311 aa12.96□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 GAB2Q9UQC2 676 aa12.96□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 TANC2Q9HCD6 1990 aa12.95□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 VWC2LB2RUY7 222 aa12.95□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 M0R036 132 aa12.95□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC25A16P16260 332 aa12.95□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 NDUFB7P17568 137 aa12.95□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 AKR1C3P42330 323 aa12.95□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 RAB7AP51149 207 aa12.95□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 ICAM4Q14773 271 aa12.95□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 AWAT1Q58HT5 328 aa12.95□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF506Q5JVG8 444 aa12.95□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 UTF1Q5T230 341 aa12.95□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF788Q6ZQV5 615 aa12.95□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 CLDND2Q8NHS1 167 aa12.95□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 MBD3L1Q8WWY6 194 aa12.95□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 LEAP2Q969E1 77 aa12.95□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM234AQ9H0X4 552 aa12.95□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 GFOD1Q9NXC2 390 aa12.95□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 DOCK11Q5JSL3 2073 aa12.95□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 DSCAML1Q8TD84 2053 aa12.95□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa12.94□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 PMS2P5A8MQ11 134 aa12.94□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP12.94□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 34.6
TSNARE1-201ENST00000307180 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 SRP19P09132 144 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 OR9G9P0C7N8 305 aa12.94□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 CT45A1Q5HYN5 189 aa12.94□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 OR10P1Q8NGE3 313 aa12.94□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 CT45A3Q8NHU0 189 aa12.94□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 S1PR3Q99500 378 aa12.94□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 PRDM13Q9H4Q3 707 aa12.94□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa12.94□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa12.94□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM178BH3BS89 294 aa12.94□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 LY86O95711 162 aa12.94□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 CD99P14209 185 aa12.94□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 HOXA5P20719 270 aa12.94□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 MAS1LP35410 378 aa12.94□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 SPINK9Q5DT21 86 aa12.94□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 TEX36Q5VZQ5 186 aa12.94□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 TIMD4Q96H15 378 aa12.94□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 CLCC1Q96S66 551 aa12.94□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 C20orf24Q9BUV8 137 aa12.94□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 TIMM9Q9Y5J7 89 aa12.94□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 USF1P22415 310 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 KIR2DS2P43631 304 aa12.93□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF726P1Q15940 193 aa12.93□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 AARDQ4LEZ3 155 aa12.93□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 KHDC3LQ587J8 217 aa12.93□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM41BQ5BJD5 291 aa12.93□□□□□ -0.34
TSNARE1-201ENST00000307180 PYY3Q5JQD4 70 aa12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms