RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 CECR9P0C854 216 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 BTCP35070 178 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 TSPOP30536 169 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 ADIPOQQ15848 244 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 MOSP00540 346 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 GPX1P07203 203 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 NBEAP1P0C6P0 100 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 IMMP1LQ96LU5 166 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 C17orf98A8MV24 154 aa17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 TNFSF10P50591 281 aa17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 CLDND2Q8NHS1 167 aa17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 WDYHV1Q96HA8 205 aa17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 RTN4RQ9BZR6 473 aa17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 FAM90A1Q86YD7 464 aa17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 DPRXA6NFQ7 191 aa17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 GPR82Q96P67 336 aa17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 PIMREGQ9BSJ6 248 aa17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV3-48P01763 117 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 CELA3AP09093 270 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 FDCSPQ8NFU4 85 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 PROB1E7EW31 1015 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 GDF15Q99988 308 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 OR4D5Q8NGN0 318 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 TUBA4BQ9H853 241 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 RAXQ9Y2V3 346 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 CACNG8Q8WXS5 425 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 RRN3P1Q2M238 152 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 OR13A1Q8NGR1 328 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 VWCEQ96DN2 955 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 DLX6P56179 175 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 RAX2Q96IS3 184 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 KIR2DL4Q99706 377 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM106BQ9NUM4 274 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 CGAP01215 116 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 BIVMQ86UB2 503 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF525Q8N782 197 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2L6O14933 153 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 SDF2L1Q9HCN8 221 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 TFF3Q07654 80 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 COPS9Q8WXC6 57 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 MYOFQ9NZM1 2061 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 ICAM4Q14773 271 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 FOXH1O75593 365 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 IGFBP2P18065 325 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 H7C2G1 150 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 PRSS2P07478 247 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 PSG7Q13046 419 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 LYPD3O95274 346 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 CCL1P22362 96 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa17.83■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 J3QRE1 110 aa17.83■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 COX6B1P14854 86 aa17.83■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 TBR1Q16650 682 aa17.83■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 RNF126Q9BV68 326 aa17.83■□□□□ 0.45
CCSAP-201ENST00000284617 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa17.83■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 MPZP25189 248 aa17.83■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 DPM3Q9P2X0 92 aa17.83■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 DOCK3Q8IZD9 2030 aa17.83■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 C7orf71A4D174 169 aa17.83■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 PEX7O00628 323 aa17.83■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 IQCF6A8MYZ5 107 aa17.83■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 ATOH7Q8N100 152 aa17.83■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD36A6QL64 1941 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A28Q96A46 364 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 FAM131CQ96AQ9 280 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 ARID2Q68CP9 1835 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 PRR19A6NJB7 356 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 NPIPB7O75200 414 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM136Q6ZRR5 245 aa17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111.3 ms