RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sirt7Q8BKJ9 402 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rps19bp1Q8C6B9 143 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1030Q8VFL5 318 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rab30Q923S9 203 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc198Q9CPZ1 294 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cdc42ep3Q9CQC5 254 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dtwd2Q9D0U1 298 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rpl7l1Q9D8M4 246 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mdp1Q9D967 164 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm20806Q9D9T3 227 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cbln3Q9JHG0 197 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fzr1Q9R1K5 493 aa5.68□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MgaA2AWL7 3003 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm11361A0A1Y7VKY1 152 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr102B2RT33 308 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr902E9Q6Z7 309 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm43191F6YIH5 235 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r194J3JS27 296 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm20918J3QN17 227 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr62L7MU75 315 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P2rx6O54803 389 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Foxh1O88621 401 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 C2cd4dP0CG09 341 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 H2-DMaP28078 261 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mcpt8P43430 247 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dvl1P51141 695 aa5.67□□□□□ -1.5
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rab11aP62492 216 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mbd6Q3TY92 1003 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 BB287469Q3UT53 144 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fbxw20Q5U467 468 aa5.67□□□□□ -1.5
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 C030005K15RikQ8BQN9 115 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gltpd2Q8K0R6 321 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vrk3Q8K3G5 453 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q8VCE4 163 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RabepkQ8VCH5 380 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr101Q920Z0 308 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tstd3Q9D0B5 157 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cst6Q9D1B1 149 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rnase6Q9D244 153 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm9817Q9D2M0 144 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ndufb8Q9D6J5 186 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Reg4Q9D8G5 157 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 DhdhQ9DBB8 333 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cdk20Q9JHU3 346 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sp5Q9JHX2 398 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prg4Q9JM99 1054 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Il17bQ9QXT6 180 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adam11Q9R1V4 773 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spry4Q9WTP2 300 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atoh7Q9Z2E5 149 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ints1Q6P4S8 2195 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm13083A2AGW5 501 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 1700031F05RikB1AX30 191 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r180B9EK86 305 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r160E9Q346 307 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r123L7N270 307 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Srsf5O35326 269 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 LepP41160 167 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ear1P97426 155 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Thbs3Q05895 956 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q3UUX7 111 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc34a1Q60825 637 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SlaQ60898 281 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tra2aQ6PFR5 281 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mtch2Q791V5 303 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrps10Q80ZK0 160 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Crispld2Q8BZQ2 495 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hist3h2bbQ8CGP0 126 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 FuomQ8R2K1 153 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Myct1Q8R411 188 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ear10Q923L6 156 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp958Q99LG7 467 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc25a2Q99ML6 265 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bcl2l14Q9CPT0 328 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Polr3kQ9CQZ7 108 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hist3h2baQ9D2U9 126 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr154Q9QY00 318 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Jag2Q9QYE5 1247 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm884A2A9H6 3643 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gtf3c1Q8K284 2101 aa5.67□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm12887B1AVM1 119 aa5.66□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm6460F6YJZ8 199 aa5.66□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ninj1O70131 152 aa5.66□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TcapO70548 167 aa5.66□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adh1P00329 375 aa5.66□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P01798 113 aa5.66□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pax1P09084 446 aa5.66□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Evx1P23683 416 aa5.66□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fgf8P37237 268 aa5.66□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 LumP51885 338 aa5.66□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rhox4gQ2MDF7 205 aa5.66□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rhox4dQ2MDG0 205 aa5.66□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CtrcQ3SYP2 268 aa5.66□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rnf224Q3UIW8 156 aa5.66□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lclat1Q3UN02 376 aa5.66□□□□□ -1.5
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rhox4eQ504P9 205 aa5.66□□□□□ -1.5
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