RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027009.10

Casp12-201, Transcript of Caspase-12, mouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casp12, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fgf3	P05524	245 aa		3.3	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gpm6a	P35802	278 aa		3.3	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fpgs	P48760	587 aa		3.3	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Clec10a	P49300	304 aa		3.3	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rps27a	P62983	156 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nrtn	P97463	195 aa		3.3	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rnf224	Q3UIW8	156 aa		3.3	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rffl	Q6ZQM0	377 aa		3.3	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slc35f2	Q7TML3	375 aa		3.3	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ttc9c	Q810A3	171 aa		3.3	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cbln4	Q8BME9	198 aa		3.3	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Prss58	Q8BW11	241 aa		3.3	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Aph1b	Q8C7N7	257 aa		3.3	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sbsn	Q8CIT9	700 aa		3.3	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr1298	Q8VGE6	312 aa		3.3	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sh3bgrl3	Q91VW3	93 aa		3.3	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rwdd2b	Q99M03	290 aa		3.3	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ntm	Q99PJ0	344 aa		3.3	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Unc50	Q9CQ61	259 aa		3.3	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fam162b	Q9CX19	157 aa		3.3	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fam219a	Q9D772	157 aa		3.3	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Uqcrb	Q9D855	111 aa		3.3	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Anxa10	Q9QZ10	324 aa		3.3	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nubp2	Q9R061	275 aa		3.3	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ramp1	Q9WTJ5	148 aa		3.3	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sipa1l3	G3X9J0	1776 aa		3.3	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rgs12	Q8CGE9	1381 aa		3.3	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ltn1	Q6A009	1767 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr1107	A2AVB8	312 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Asmt	D3KU66	387 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm9920	D3YVZ2	140 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	C530025M09Rik	F6RGA8	229 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tspan15	F7BWT7	294 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm2381	G3UY53	305 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	S100a2	J3QMC7	104 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm7137	J3QMW1	236 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mras	O08989	208 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009		P01634	136 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lif	P09056	203 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Znf271	P15620	580 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rag2	P21784	527 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rps28	P62858	69 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	1700013D24Rik	Q0P521	120 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm94	Q3V2D2	93 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pabpn1l	Q5XFR0	273 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmem45a	Q60774	273 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr1385	Q7TQT1	309 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Negr1	Q80Z24	348 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmem234	Q8R1E7	140 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mavs	Q8VCF0	503 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr669	Q8VGU9	317 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ncald	Q91X97	193 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sectm1a	Q921W8	192 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Smagp	Q99KC7	97 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Atp5l	Q9CPQ8	103 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmem216	Q9CQC4	141 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Grifin	Q9D1U0	144 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Golt1a	Q9DCQ3	133 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gstz1	Q9WVL0	216 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Wisp2	Q9Z0G4	251 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm28171	A0A087WQ19	227 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009		A0A286YDM5	308 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmem74b	A2AU34	232 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm14295	A2BG91	834 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rnf39	A2RT81	352 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm17333	C6EQI3	125 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr248	E9Q1L6	309 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zfp764	E9QAP1	431 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm21746	J3QMM6	180 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dhcr7	O88455	471 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009		P01635	115 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Klk1b16	P04071	261 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Bpifa2	P07743	235 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Prdx1	P35700	199 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Serpina7	P61939	418 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rps3	P62908	243 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fgf17	P63075	216 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fthl17f	Q3SXD2	176 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Znf354a	Q61751	572 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Eng	Q63961	653 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Spin2c	Q6NVE3	257 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fam107a	Q78TU8	144 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gng5	Q80SZ7	68 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pcyt1b	Q811Q9	369 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tacstd2	Q8BGV3	317 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Arsj	Q8BM89	598 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Il33	Q8BVZ5	266 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hlf	Q8BW74	295 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmem41b	Q8K1A5	291 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	0610009B22Rik	Q8R3W2	140 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Naa40	Q8VE10	237 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pdcd10	Q8VE70	212 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr1183	Q8VFF8	303 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr1030	Q8VFL5	318 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr961	Q9EQ84	314 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr888	Q9EQA5	314 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Il18bp	Q9Z0M9	193 aa		3.29	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Psme4	Q5SSW2	1843 aa		3.28	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Trav6d-7	A0A075B6B0	112 aa		3.28	□□□□□ -1.88
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Trav11	A0A0B4J1J9	114 aa		3.28	□□□□□ -1.88

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 112 ms