RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 C17orf50Q8WW18 174 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 ASB13Q8WXK3 278 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 CFHR4Q92496 578 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 CYYR1Q96J86 154 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 HARBI1Q96MB7 349 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 GON7Q9BXV9 100 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 MED28Q9H204 178 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 OR51J1Q9H342 316 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 CCL28Q9NRJ3 127 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 TNFRSF19Q9NS68 423 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 COMMD9Q9P000 198 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 CACFD1Q9UGQ2 172 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 KMT2AQ03164 3969 aa6.21□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa6.2□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 NBR2O15453 112 aa6.2□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 FCGR3BO75015 233 aa6.2□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 CRYZL1O95825 349 aa6.2□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 HPRT1P00492 218 aa6.2□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 RLN1P04808 185 aa6.2□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 SULT1A3P0DMM9 295 aa6.2□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.2□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 NQO2P16083 231 aa6.2□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 F2RP25116 425 aa6.2□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 PIGPP57054 158 aa6.2□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 DHODHQ02127 395 aa6.2□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa6.2□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.2□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM177Q53S58 311 aa6.2□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.2□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 UTF1Q5T230 341 aa6.2□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.2□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 NOXA1Q86UR1 476 aa6.2□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 FOXRED2Q8IWF2 684 aa6.2□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 SPAG16Q8N0X2 631 aa6.2□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 OR13C8Q8NGS7 320 aa6.2□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 OR51H1Q8NH63 302 aa6.2□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 MARCH1Q8TCQ1 289 aa6.2□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.2□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.2□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.2□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 H0Y980 276 aa6.19□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 RRHO14718 337 aa6.19□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 RGS13O14921 159 aa6.19□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 MPPED1O15442 326 aa6.19□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 TNFSF12O43508 249 aa6.19□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 SNAPC5O75971 98 aa6.19□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 S100A1P23297 94 aa6.19□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 CD83Q01151 205 aa6.19□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 HNF4GQ14541 408 aa6.19□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 TBC1D26Q86UD7 250 aa6.19□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM219Q86XT9 240 aa6.19□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF383Q8NA42 475 aa6.19□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 TEX45Q8NA69 505 aa6.19□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 NPBQ8NG41 125 aa6.19□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 OR4D10Q8NGI6 311 aa6.19□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 OR4A5Q8NH83 315 aa6.19□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 PIFOQ8TCI5 191 aa6.19□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 DDB2Q92466 427 aa6.19□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 HYLS1Q96M11 299 aa6.19□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa6.18□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.18□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 CYB5BO43169 146 aa6.18□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 SSNA1O43805 119 aa6.18□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 ATP6V1G1O75348 118 aa6.18□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 TSPAN9O75954 239 aa6.18□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 NDUFA3O95167 84 aa6.18□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 CNIH1O95406 144 aa6.18□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 IGLV2-14P01704 120 aa6.18□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 FGF2P09038 288 aa6.18□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF735P0CB33 412 aa6.18□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 CD24P25063 80 aa6.18□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 MAS1LP35410 378 aa6.18□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 UBE2KP61086 200 aa6.18□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 SLC35B1P78383 322 aa6.18□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 CD69Q07108 199 aa6.18□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 FCN2Q15485 313 aa6.18□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.18□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM128Q5BJH2 165 aa6.18□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 C9orf152Q5JTZ5 239 aa6.18□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 LIN54Q6MZP7 749 aa6.18□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 FAAP20Q6NZ36 180 aa6.18□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.18□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 MMD2Q8IY49 270 aa6.18□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 Q8N6K4 173 aa6.18□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.18□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 DMBX1Q8NFW5 382 aa6.18□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
ZNF548-208ENST00000597576 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms