RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 CACNG5Q9UF02 275 aa9.66□□□□□ -0.86
GGA3-217ENST00000583667 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
GGA3-217ENST00000583667 MARCH11A6NNE9 402 aa9.65□□□□□ -0.86
GGA3-217ENST00000583667 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa9.65□□□□□ -0.86
GGA3-217ENST00000583667 GPR137BO60478 399 aa9.65□□□□□ -0.86
GGA3-217ENST00000583667 FCGR3BO75015 233 aa9.65□□□□□ -0.86
GGA3-217ENST00000583667 HRASP01112 189 aa9.65□□□□□ -0.86
GGA3-217ENST00000583667 FGF2P09038 288 aa9.65□□□□□ -0.86
GGA3-217ENST00000583667 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
GGA3-217ENST00000583667 RPL12P30050 165 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
GGA3-217ENST00000583667 S100A10P60903 97 aa9.65□□□□□ -0.86
GGA3-217ENST00000583667 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
GGA3-217ENST00000583667 RTL8BQ17RB0 113 aa9.65□□□□□ -0.86
GGA3-217ENST00000583667 TMEM177Q53S58 311 aa9.65□□□□□ -0.86
GGA3-217ENST00000583667 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa9.65□□□□□ -0.86
GGA3-217ENST00000583667 FOXRED2Q8IWF2 684 aa9.65□□□□□ -0.86
GGA3-217ENST00000583667 ZNF680Q8NEM1 530 aa9.65□□□□□ -0.86
GGA3-217ENST00000583667 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
GGA3-217ENST00000583667 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
GGA3-217ENST00000583667 SMIM8Q96KF7 97 aa9.65□□□□□ -0.86
GGA3-217ENST00000583667 NABP2Q9BQ15 211 aa9.65□□□□□ -0.86
GGA3-217ENST00000583667 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
GGA3-217ENST00000583667 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
GGA3-217ENST00000583667 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
GGA3-217ENST00000583667 WSB1Q9Y6I7 421 aa9.65□□□□□ -0.86
GGA3-217ENST00000583667 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa9.64□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa9.64□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 MSGN1A6NI15 193 aa9.64□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 H0YJW9 148 aa9.64□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 SYNGR2O43760 224 aa9.64□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 CHST1O43916 411 aa9.64□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 MED6O75586 246 aa9.64□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 IFNA7P01567 189 aa9.64□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 G6PCP35575 357 aa9.64□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 PAX9P55771 341 aa9.64□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP9.64□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 ZNF429Q86V71 674 aa9.64□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 PDPNQ86YL7 162 aa9.64□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 STOML3Q8TAV4 291 aa9.64□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 PHYHIPLQ96FC7 376 aa9.64□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 ARPC5LQ9BPX5 153 aa9.64□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 SLC25A31Q9H0C2 315 aa9.64□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 CYTL1Q9NRR1 136 aa9.64□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 SLC35D1Q9NTN3 355 aa9.64□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 ODF3BA8MYP8 253 aa9.63□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 OOSP1A8MZH6 123 aa9.63□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 TSC22D2O75157 780 aa9.63□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 TMEM50AO95807 157 aa9.63□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 SCGB1D2O95969 90 aa9.63□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 APOA2P02652 100 aa9.63□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 RAB13P51153 203 aa9.63□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 ERVK-16P61578 105 aa9.63□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 ARF6P62330 175 aa9.63□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 UBA52P62987 128 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 TNFRSF9Q07011 255 aa9.63□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 OR2B11Q5JQS5 317 aa9.63□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 HCP5Q6MZN7 132 aa9.63□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa9.63□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 OR2C3Q8N628 320 aa9.63□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 OR8H1Q8NGG4 311 aa9.63□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 OR4P4Q8NGL7 312 aa9.63□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 LHX4Q969G2 390 aa9.63□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 RHOVQ96L33 236 aa9.63□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 RNF5Q99942 180 aa9.63□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 SIRPDQ9H106 197 aa9.63□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 ONECUT1Q9UBC0 465 aa9.63□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 TRIM77I1YAP6 450 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 WRBO00258 174 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 LGALS7P47929 136 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 UBE2KP61086 200 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 VAMP2P63027 116 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 RELBQ01201 579 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 BAXQ07812 192 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 NDUFA5Q16718 116 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 MINOS1Q5TGZ0 78 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 TMEM252Q8N6L7 170 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 OR4C13Q8NGP0 309 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 BET1LQ9NYM9 111 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 ZNRD1Q9P1U0 126 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 DPM3Q9P2X0 92 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 WASHC3Q9Y3C0 194 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 DOCK11Q5JSL3 2073 aa9.62□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 LEUTXA8MZ59 168 aa9.61□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 JTBO76095 146 aa9.61□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 CRYZL1O95825 349 aa9.61□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 CFDP00746 253 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
GGA3-217ENST00000583667 EPHA1P21709 976 aa9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms