RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577256.5

ATG13-223, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 4

Gene ATG13, Length 613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-223	ENST00000577256	GPR31	O00270	319 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	MPPED1	O15442	326 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	BRI3	O95415	125 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	HPRT1	P00492	218 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	MAS1L	P35410	378 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	TAS2R31	P59538	309 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	KLK11	Q9UBX7	282 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256		A0A0G2JLM5	398 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	NQO2	P16083	231 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	TBP	P20226	339 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	S100G	P29377	79 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	SSX9	Q7RTT3	188 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	OR4A5	Q8NH83	315 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	COA4	Q9NYJ1	87 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	BET1L	Q9NYM9	111 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	GABARAP	H6UMI1	98 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256		M0QYG6	137 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	RLN1	P04808	185 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	IFNA6	P05013	189 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	OR9G9	P0C7N8	305 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	F2R	P25116	425 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	UCP3	P55916	312 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	POU2AF1	Q16633	256 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	COMMD9	Q9P000	198 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ATG13-223	ENST00000577256	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	LINC01619	G3V211	115 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	IGHV3-11	P01762	117 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	APELA	P0DMC3	54 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	OR4A47	Q6IF82	309 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	CCDC160	A6NGH7	325 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	S1PR2	O95136	353 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	CD3D	P04234	171 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	TAS2R19	P59542	299 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	ERVK-16	P61578	105 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	DGCR2	P98153	550 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	USMG5	Q96IX5	58 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256		A0A087WW49	117 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	CTDSPL	O15194	276 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	FGF2	P09038	288 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	HLA-G	P17693	338 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	IL18	Q14116	193 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	MCFD2	Q8NI22	146 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	TEX22	C9J3V5	150 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	UPK2	O00526	184 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	RAB3D	O95716	219 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	CD74	P04233	296 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF735	P0CB33	412 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	LPAR6	P43657	344 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	TMEM140	Q9NV12	185 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	DPPA5	A6NC42	116 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	HMX3	A6NHT5	357 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	MARCH11	A6NNE9	402 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ATG13-223	ENST00000577256	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		13.6	□□□□□ -0.23

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