RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 ALDH3B2P48448 385 aa13.17□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 TAS2R31P59538 309 aa13.17□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 POU2AF1Q16633 256 aa13.17□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPR107Q5VW38 600 aa13.17□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 ACSM6Q6P461 480 aa13.17□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa13.17□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPR141Q7Z602 305 aa13.17□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM223AQ8IWN6 122 aa13.17□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa13.17□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 TTC9CQ8N5M4 171 aa13.17□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR6F1Q8NGZ6 308 aa13.17□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 BET1LQ9NYM9 111 aa13.17□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 HPGDSO60760 199 aa13.16□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 SAP30O75446 220 aa13.16□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 HPRT1P00492 218 aa13.16□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 PMP2P02689 132 aa13.16□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 NQO2P16083 231 aa13.16□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 GNRHRP30968 328 aa13.16□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 ECI1P42126 302 aa13.16□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 RPL8P62917 257 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM209BQ5JX69 171 aa13.16□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF343Q6P1L6 599 aa13.16□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 CMTM1Q8IZ96 169 aa13.16□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 C15orf40Q8WUR7 153 aa13.16□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPHA2Q96T91 129 aa13.16□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 ELOVL1Q9BW60 279 aa13.16□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLEKHA2Q9HB19 425 aa13.16□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 COMMD9Q9P000 198 aa13.16□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa13.16□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa13.15□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 NPIPB5A8MRT5 1133 aa13.15□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 APELAP0DMC3 54 aa13.15□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 HRH1P35367 487 aa13.15□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 C10orf55Q5SWW7 151 aa13.15□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 AADACL3Q5VUY0 350 aa13.15□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 LPCAT3Q6P1A2 487 aa13.15□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 SNX29P2Q8IUI4 249 aa13.15□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 LYSMD2Q8IV50 215 aa13.15□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 NECAP1Q8NC96 275 aa13.15□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR51H1Q8NH63 302 aa13.15□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 B9D2Q9BPU9 175 aa13.15□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 COL7A1Q02388 2944 aa13.14□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM25AB3EWG3 89 aa13.14□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM25CB3EWG5 89 aa13.14□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM25GB3EWG6 89 aa13.14□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 DHFRP00374 187 aa13.14□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF735P0CB33 412 aa13.14□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 HLA-GP17693 338 aa13.14□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 HLA-DMAP28067 261 aa13.14□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 S100GP29377 79 aa13.14□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 RHOGP84095 191 aa13.14□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR4A47Q6IF82 309 aa13.14□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 CADM3Q8N126 398 aa13.14□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa13.14□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR4C12Q96R67 309 aa13.14□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 BCL7BQ9BQE9 202 aa13.14□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC2A9Q9NRM0 540 aa13.14□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 RYR3Q15413 4870 aa13.14□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 DPPA5A6NC42 116 aa13.13□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 TEX22C9J3V5 150 aa13.13□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPR31O00270 319 aa13.13□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 F2RP25116 425 aa13.13□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 TSPAN5P62079 268 aa13.13□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATP5G2Q06055 141 aa13.13□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 SSX9Q7RTT3 188 aa13.13□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 HRASLSQ9HDD0 168 aa13.13□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 AKIP1Q9NQ31 210 aa13.13□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANKRD34BA5PLL1 514 aa13.12□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 RLN1P04808 185 aa13.12□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 ERVK-16P61578 105 aa13.12□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 CD69Q07108 199 aa13.12□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 TATDN3Q17R31 274 aa13.12□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 VAX1Q5SQQ9 334 aa13.12□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 DMBX1Q8NFW5 382 aa13.12□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAB2BQ8WUD1 216 aa13.12□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRR25Q96S07 402 aa13.12□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 FXYD6Q9H0Q3 95 aa13.12□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 HMX3A6NHT5 357 aa13.11□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 UPK2O00526 184 aa13.11□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 S1PR2O95136 353 aa13.11□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 CRYGCP07315 174 aa13.11□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 TBPP20226 339 aa13.11□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 UCP3P55916 312 aa13.11□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF45Q02386 682 aa13.11□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 RPEL1Q2QD12 228 aa13.11□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 KLK9Q2XQG4 91 aa13.11□□□□□ -0.31
CCNDBP1-211ENST00000567434 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms