RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566376.3

TCF4-233, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 462 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-233	ENST00000566376	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	IGHV3-11	P01762	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	HLA-DQB1	P01920	261 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	APELA	P0DMC3	54 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	DTYMK	P23919	212 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	MYL9	P24844	172 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	LIN54	Q6MZP7	749 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	FCGR1B	Q92637	280 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	ARPC1A	Q92747	370 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	B9D2	Q9BPU9	175 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376		H7C2Y5	167 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376		J3QRK9	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	PDCD5	O14737	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	MPPED1	O15442	326 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	HSPA12A	O43301	675 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	CRYZL1	O95825	349 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	FCER2	P06734	321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	CD36	P16671	472 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	SERPINB10	P48595	397 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	RAB25	P57735	213 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	ZNF616	Q08AN1	781 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	CDNF	Q49AH0	187 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	HARBI1	Q96MB7	349 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	MS4A10	Q96PG2	267 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	RNF5	Q99942	180 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	VSIG4	Q9Y279	399 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	RAMP3	O60896	148 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	BRI3	O95415	125 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	PRH1	P02810	166 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	OR5H8	P0DN80	308 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	SPN	P16150	400 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	AADAC	P22760	399 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	MC5R	P33032	325 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	PSMD7	P51665	324 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	UBE2K	P61086	200 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	NCS1	P62166	190 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	ARFRP1	Q13795	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	FXYD3	Q14802	87 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	PRSS8	Q16651	343 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	ACTBL2	Q562R1	376 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376		Q6ZNX1	250 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	TPRA1	Q86W33	373 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	POC5	Q8NA72	575 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	GON7	Q9BXV9	100 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	GHITM	Q9H3K2	345 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	KIAA1456	Q9P272	454 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	ZNF221	Q9UK13	617 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	DNAH2	Q9P225	4427 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-233	ENST00000566376	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	HMX3	A6NHT5	357 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	LINC01619	G3V211	115 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	BMPR1B	O00238	502 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	OVOL1	O14753	267 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	IGLV1-51	P01701	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	APOA2	P02652	100 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	OR8U8	P0C7N1	319 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	AREG	P15514	252 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	TPPP2	P59282	170 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	KLK9	Q2XQG4	91 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-233	ENST00000566376	IDNK	Q5T6J7	187 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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