RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	FXYD4	P59646	89 aa		16.65	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	VBP1	P61758	197 aa		16.65	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	RHOG	P84095	191 aa		16.65	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		16.65	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	IFT46	Q9NQC8	304 aa		16.65	■□□□□ 0.26
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM223B	A6NKX1	122 aa		16.64	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	IGLV1-51	P01701	117 aa		16.64	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	16.64	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	GP9	P14770	177 aa		16.64	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	GNRHR	P30968	328 aa		16.64	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	MAS1L	P35410	378 aa		16.64	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	RFX2	P48378	723 aa		16.64	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		16.64	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		16.64	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		16.64	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		16.64	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	HMX3	A6NHT5	357 aa		16.63	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	SULT1C2	O00338	296 aa		16.63	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF735	P0CB33	412 aa		16.63	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	SMIM18	P0DKX4	95 aa		16.63	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	SSX9	Q7RTT3	188 aa		16.63	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM17	Q86X19	198 aa		16.63	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		16.63	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	CMTM3	Q96MX0	182 aa		16.63	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	BET1L	Q9NYM9	111 aa		16.63	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	EHF	Q9NZC4	300 aa		16.63	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		16.63	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		16.63	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	PRSS3	P35030	304 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	16.62	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	SYNJ2BP	P57105	145 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	POU2AF1	Q16633	256 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4A47	Q6IF82	309 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	NECAP1	Q8NC96	275 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	APOA1	P02647	267 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	TAS2R31	P59538	309 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	16.62	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP5G2	Q06055	141 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	CATR1	Q13166	79 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	KLK9	Q2XQG4	91 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4A5	Q8NH83	315 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	GPX8	Q8TED1	209 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	MOB3A	Q96BX8	217 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		16.62	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	CGB1	A6NKQ9	187 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	HPRT1	P00492	218 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	PMP2	P02689	132 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	CRYGC	P07315	174 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	TAS2R46	P59540	309 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	HERV-K104	P61576	105 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	16.61	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	CTF1	Q16619	201 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	16.61	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		16.61	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	16.6	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	BMPR1B	O00238	502 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	MYOD1	P15172	320 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	AREG	P15514	252 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	HLA-G	P17693	338 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	OR51H1	Q8NH63	302 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	BORCS5	Q969J3	196 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	16.6	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	16.6	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		16.6	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2J3	O76001	311 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	GABARAP	O95166	117 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	NQO2	P16083	231 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	ELK1	P19419	428 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	RPEL1	Q2QD12	228 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	C15orf32	Q32M92	178 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	ASCL2	Q99929	193 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200		U3KQK5	164 aa		16.59	■□□□□ 0.25
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		16.58	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	16.58	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	CSN3	P07498	182 aa		16.58	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	FGF2	P09038	288 aa		16.58	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	CTRB1	P17538	263 aa		16.58	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	PSMB6	P28072	239 aa		16.58	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	HRH1	P35367	487 aa		16.58	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2B8P	P59922	312 aa		16.58	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		16.58	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200		Q8N1Y9	231 aa		16.58	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		16.58	■□□□□ 0.24
PPP4C-205	ENST00000563200	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		16.58	■□□□□ 0.24

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