RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560353.1

APH1B-208, Transcript of aph-1 homolog B, gamma-secretase subunit, humanhuman

TSL 3

Gene APH1B, Length 672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1B-208ENST00000560353 ETV7Q9Y603 341 aa7.37□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 TEX22C9J3V5 150 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 K7EMT4 169 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 CRYZL1O95825 349 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 DEFA4P12838 97 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 RPA2P15927 270 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 TFPI2P48307 235 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 Q5VSD8 79 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 KDM4DQ6B0I6 523 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 SSX9Q7RTT3 188 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 CDH26Q8IXH8 852 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 NICN1Q9BSH3 213 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 BATF3Q9NR55 127 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 RDH8Q9NYR8 311 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 MGAT4AQ9UM21 535 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 X6R8D5 127 aa7.36□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 FAT1Q14517 4588 aa7.35□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 MFSD2BA6NFX1 497 aa7.35□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 G3V2T6 193 aa7.35□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 FKBP6O75344 327 aa7.35□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 IRF3Q14653 427 aa7.35□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 C6orf201Q7Z4U5 140 aa7.35□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.35□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 ZNF502Q8TBZ5 544 aa7.35□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 ORAI1Q96D31 301 aa7.35□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 LGALS12Q96DT0 336 aa7.35□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 ADTRPQ96IZ2 230 aa7.35□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 OR2A7Q96R45 310 aa7.35□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 C20orf24Q9BUV8 137 aa7.35□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 SDHAF2Q9NX18 166 aa7.35□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 TBC1D24Q9ULP9 559 aa7.35□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.35□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa7.34□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa7.34□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.34□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 SNTNA6NMZ2 147 aa7.34□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 TGOLN2O43493 480 aa7.34□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 DFFBO76075 338 aa7.34□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 AREGP15514 252 aa7.34□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 PAFAH1B2P68402 229 aa7.34□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 HLA-DRB3P79483 266 aa7.34□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 CCDC58Q4VC31 144 aa7.34□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.34□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 MEDAGQ5VYS4 303 aa7.34□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 STHQ8IWL8 128 aa7.34□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 CMTM3Q96MX0 182 aa7.34□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 RNF2Q99496 336 aa7.34□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.34□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 OR2D2Q9H210 308 aa7.34□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 ERVK13-1Q9NX77 482 aa7.34□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 GHRLQ9UBU3 117 aa7.34□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 SMPXQ9UHP9 88 aa7.34□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 TMED3Q9Y3Q3 217 aa7.34□□□□□ -1.23
APH1B-208ENST00000560353 AGRNO00468 2067 aa7.34□□□□□ -1.23
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APH1B-208ENST00000560353 C15orf62A8K5M9 175 aa7.33□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 NDUFA4O00483 81 aa7.33□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 DCTN3O75935 186 aa7.33□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 ZNF735P0CB33 412 aa7.33□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 SPP1P10451 314 aa7.33□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 MAS1LP35410 378 aa7.33□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 SERPINB10P48595 397 aa7.33□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 PSMD7P51665 324 aa7.33□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 GIMAP1Q8WWP7 306 aa7.33□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 CIB1Q99828 191 aa7.33□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 OR51E2Q9H255 320 aa7.33□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 TMEM14BQ9NUH8 114 aa7.33□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 THYN1Q9P016 225 aa7.33□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 AASSQ9UDR5 926 aa7.33□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa7.32□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa7.32□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 A0A1B0GW64 132 aa7.32□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 E7EUB6 86 aa7.32□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 RGS13O14921 159 aa7.32□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 KRTAP10-2P60368 255 aa7.32□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 LEMD1Q68G75 181 aa7.32□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 SPSB3Q6PJ21 355 aa7.32□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 ZNF66Q6ZN08 573 aa7.32□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 SPATA24Q86W54 205 aa7.32□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 GBGT1Q8N5D6 347 aa7.32□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 SYT8Q8NBV8 401 aa7.32□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 UQCC2Q9BRT2 126 aa7.32□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa7.32□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa7.32□□□□□ -1.24
APH1B-208ENST00000560353 GABARAPL3Q9BY60 117 aa7.32□□□□□ -1.24
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